成功募兵於銅山。己丑，遣施瑯、楊才、柯宸樞、康明等攻拔漳浦，遂下雲霄鎮，抵詔安，移屯分水關南岡，留宸樞守盤陀嶺。王師進攻嶺，宸樞死。其秋七月，張名振、阮進迎魯王居健跳所。成功遣光祿卿陳士京朝於肇慶，始用桂王年號。
九月，名振等討斬黃斌卿，魯王移屯舟山，遣阮美如日本乞師。
庚寅春正月，桂王自肇慶西奔梧州。成功入潮州、南洋、剿楊廣、許隆；渡達濠，誅張禮；剿新墟、金田等寨，皆平之。夏六月，進攻蘇利於碣石衛。施瑯來奔。秋八月，成功襲取廈門，殺鄭聯，並其軍。張名振、阮進、周崔芝，擊破鄭彩兵於沙埕，彩引餘眾逃南海。數年，軍人星散，舟楫損壞，成功招之以書，喜曰：“今不歸後無期矣。”遂還廈門，卒於家。
辛卯春，成功南次平海，閩撫張學聖使泉州守將馬得功乘虛襲廈門，入之，前大學士曾櫻自縊死，諸紳咸避於浯嶼。學聖與漳泉道黃澍登山，望島孤懸海外，汪洋萬頃，憮然曰：“此絕地也！脫緩急，豈望救乎？”遽引還。未數日，鴻逵自揭陽來，得功欲退，不得渡，乃好語鴻逵曰：“我不出，島必不全。且公家在安平內地，請熟慮。”鴻逵縱之出。四月朔，成功還至島，得功去已二日，大悔恨。按失島罪，斬其叔芝莞，諸將股栗，軍勢復振。
五月，入漳州南溪，敗鎮將王邦俊、提督揚名高，自福州步騎來救，迎戰於小盈嶺，名高大敗。乘勝徇漳浦，守將楊世臣、陳光策降。
是年九月，陳錦克舟山，定西侯張名振奉魯王南奔，謀取海壇駐師，致書勸成功會師迎駕。魯王亦與之書曰：“餘與公宗盟也，平居則歌行葦之章，際難合賦脊令之什，公其無吝偏師，拯此同患。”成功乃令兵科給事中徐孚遠，前至魯王行宮，面啟永歷見正位粵西，宜去監國號。王復書，敘所以勉從監國意。乃使奉迎，居王金門，如寓公焉。名振，阮駿等兵皆屬成功。
壬辰二月，成功進取海澄，守將郝文興以城降。陳錦來援，成功簡精銳待江東橋北，錦狃於同安之役，意甚輕敵，及戰，大敗，奔回泉州。六月，成功取詔安、南靖、平和，遂圍漳州，兵至二十餘萬。同知張箸、推官石瑋，堅守不下。金衢總兵馬晉寶來救，成功縱之入城，數日，出戰而敗，復退守陴。南軍晝夜百道攻城。距漳三十里有鎮門，兩山屬岸，築斷激水灌城，復列棚圍之。城中升米銀數兩，草木之實俱盡，敢弩掘鼠。
陳錦在鳳凰山，為其下庫成棟所刺，以其首奔成功，全閩大震。
漳圍至八閱月，中外困隔。浙江固山額真、金礪、固山大溫都力敖童梅勒、章京徐大貴總滿洲烏金超哈兵與提督名高由長泰間道直抵漳城北，成功營城南鳳窠山，乘高壓壘。王師銳甚，為兩翼擊，島人久敝堅城，皆無鬥志。十月三日，解圍，退屯古縣。合戰，崩潰，追奔四十餘里，積屍布野。成功入海澄，嬰城守。守道周亮工，收漳城骸骨七十三萬，焚瘞一大穴，碑曰“同歸所”。
是年秋，張名振北，師次崇明沙，破鎮江，登金山，江南北戒嚴。
癸已夏，金礪進攻海澄，成功與諸將飲酒敵樓，指揮治軍。
夜，大將王秀奇、郝文興聞空炮發，曰：“師臨城矣。”令其下皆用斧，令曰：“敵至而斲。”有頃，師盡銳渡海，秀奇等大呼登城，斧齊下，先登悉填濠，礪連夜拔圍去。
是年，西寧王定國自武岡還，入廣西，圍肇慶，新泰侯郝尚久以潮州應定國，平南王尚可喜救肇慶，定國退。靖南王耿繼茂、將軍哈哈木急攻潮州，尚久以鴻逵前人揭陽，有隙。至是，因郝文興來乞師，成功遣陳六御救之，竟疑，不敢開城納兵。九月，潮州破，六御乃攻鷗汀埧等寨，引還。
定國之在肇慶也，以書抵成功，請會師。成功得書，往報師期，並上諸將戰勛於行在。是年張名振復退大軍於崇明之平洋沙。西甯王定國進封晉王。
八月，平國公芝龍遣家僕李德歸閩，講撫，成功繆諾，因以休士觀釁。因朝命金礪撤兵還浙，而封芝龍同安侯、學士鄭庫納賚詔及海澄公敕印授成功，封鴻逵奉化伯，芝豹左都督。
成功宴使者安平，辭以未裂土，不受爵。而遺書總督劉清泰，謂數十萬眾按甲待和，豈能枵腹？欲就漳、泉、興、福各屬，權宜借餉。不待報，遽遣官四出。清泰密諭諸城守斂戌避。鄭蝦還言成功三議：一先割四府，二不奉調，三不受部撫節制。
又比高麗不剃頭，恐如姜驤、金聲桓等降後激變。芝龍恐其子不受詔，復為書與弟鴻逵，使勸之。鴻逵復書，述：“大姪在中左，弟在白沙，兼渠行師所居靡定，相見尤罕，其肯聽弟之言乎？”芝龍悵然，無可奈何。
甲午，成功偽設六官，改中左所為思明州，以鄧會知州事。
月上魯王豚米及濾溪、寧靖，諸宗室，禮待鄉紳王忠孝、沈佺期、郭貞一、盧若騰、華朝薦、徐孚遠等，軍國大事，輒以相諮。考諸生學秀者入儲賢館。
是年，張名振、阮駿再入崇明所，奪北舟及歸者至五日餘艘。別將顧忠至天津，邀糧艘百餘。名振登金