经过一场海战的大胜之后，全琮舰队原本因为远离故土而导致的士气日益下降的困境，终于得到了改善。舰队的士卒们，个个都开始又变得生龙活虎了。
但是，经过这次海战之后，全琮的舰队即使是取得了大胜，但是却也有战舰受到了伤害，需要靠岸交给随军通行的造船厂技工进行修复。
何况，新缴获的四艘海盗船的损伤其实也非常严重，必须要赶紧对他们进行修复，否则战斗力根本近乎完全丧失。
而且，舰队从海盗舰队缴获了不少货物，这些东西对于他们而言没有任何用处，也需要找到地方出手，或者将它们换成需要的各种补给物资才合算，否则白白占据了舱位实在是一件非常浪费的事情。
全琮接下来将舰队重新编列队形之后，对那些在海战之中阵亡的士卒进行了海葬，然后才指挥舰队向着婆罗洲而去。
舰队很快就通过了南沙群岛海域。
但是全琮的舰队似乎在此次远洋航行之中，显得并不十分幸运。他们的舰队在海上遇到了风暴，舰队的编队被完全冲散，战舰之间也失去了联系。
后来经过舰队的统计，全琮的旗舰威南号因为吨位巨大，所以损伤并不是很大，只有左舷出现了一些伤害，有些漏水，被船上的士卒进行紧急修复之后安然无恙。
但是其他的战舰有的就比较不幸，其中三艘战舰的桅杆被风暴吹断，两艘战舰舰体出现比较严重破损，船舱里面进水非常严重。
其他战舰的状况，倒是都还好。
另外，还有一百二十个士卒，在此次风暴之中遇难，还有三百多人受伤，急需要赶快治疗。
这些状况其实还不是最为糟糕的。
最为糟糕的是，全琮的舰队在这次风暴之中被冲散。
等到风暴结束之后，威南号周围海域只剩下了八艘战舰，以及两艘补给船，还有少量的警戒船。警戒船上面的船员早就在风暴过来的时候，就及时登到了大型战舰上面幸免于难，但是不少警戒船都被巨大的海浪冲走或者损毁了。
全琮走上甲板，望着空荡荡的海面，大部分的舰船都已经完全不见了踪影。
全琮心里非常担心他们的安全。而且那些补给舰装满了舰队所需要的物资，就是从林邑国带出来的应急资金和从海盗舰队搜到的财富，也大部分都放在了它们那里。如果失去那些物资的话，对全琮的舰队而言，无异于是一场灭顶之灾。
不过，全琮坚信舰队即使有所损失，但是应该不至于太大。
于是，全琮传令全体舰船做再次损伤评估后，重新启动向着原先约定的集合地点婆罗乃以缓慢的速度前进。（婆罗乃，也就是今日文莱的古称burunei的音译。）
它们的速度之所以下降，一方面是因为所有战舰都有受损，另外一方面，风暴过后，海上的风向有些变化。
威南号的后面还拖着受损最为严重的先锋号，速度不得不也跟着放缓了很多。
全琮的舰队经过了艰苦的八天的海上缓慢航行之后，终于是到达了预定集合地点婆罗乃海湾，然后调转方向进入西南方向的斯里巴加湾（岸上的海滨平原就是今日文莱的首都）。
斯里巴加湾是海洋深入陆地而形成的海湾，三面都是陆地，是一处很好的避风港湾。西面所面对的就是婆罗乃河的河口，全琮的舰队还可以那里获得大量的淡水补给。
而且，值得一提的是，在全琮的舰队向婆罗乃海湾慢速行进的途中，又有八艘战舰和三艘补给船追了上来，这些船只也跟着威南号一同进入了斯里巴加湾。
至于其余的舰船，至今却还没有见到他们过来集合的样子。
全琮虽然心里变得越发地着急起来，毕竟这是他第一次遭遇到这样的状况，这时候也只能够向老天祈祷，让其他失去联系的战舰赶快赶过来才好。
但是有些战舰确实是永远也赶不过来集合了。
大湖号战舰本来在与海盗舰队作战的时候就有受损，后来又遭遇到了风暴的袭击，船上的桅杆被大风吹断，顺着海流漂浮出了数百里之外，最终严重触礁，导致船体近乎完全倾覆。
船上的士卒虽然竭尽全力进行修复，但是三个时辰之后，大湖号终于是彻底沉没在南海，船上的七百人士卒从此全部失踪。
另外损失的舰船还有两艘缴获的海盗船。余下的两艘直到半个月之后，才被由英勇号率领的另外八艘战舰拖入了婆罗乃海湾。
而且，更加郁闷的是，还有两外的数艘战舰因为走错了方向，最终停靠在了婆罗乃海湾入口北方的纳闽岛湾。
双方其实已经都处于同一片海湾了，却无法及时会合在一起，让人白白担心。直到后来全琮的舰队驶出了婆罗乃海湾的时候，他们才发现了全琮的舰队的踪迹，匆匆忙忙地赶来会合。
全琮的舰队进入了斯里巴加湾附近的海面，随即驶入了婆罗乃河口附近。
他们需要在那里的沿岸靠岸，一方面需要就地取材修复受损的舰船，另一方面也需要从陆地进行物资补给。毕竟，他们跟大部分的补给船都失散了，这一路上过来的时候，把物资消耗得非常严重。
当天下午时分，全琮下令让警戒船进入婆罗乃河查看水文状况，让人欣喜的时候，河水的水深远远超出了预料，很多地方都有二十尺深，甚至于连威南号这样超大型战舰都可以安然进入。
于是，为了不堵塞