第一章《伊贺忍者村》第一话《零的身世》
在一个漆黑的夜晚，四处都笼罩着死亡气息的战场，到处都是诡异的黑色火焰。这里几乎没有活人，但是有着各种烧焦的尸首，有的人形尸体如巨人一般，亦有许多普通人类的尸体。
就在这些尸体中跪着一个赤裸上身的少年，他身上拥有许多黑色如同符咒的纹身，手里握着一把断掉的忍者刀，长到腰间的头发散开随风飘动着。他已耗尽所有力气，就连哭的力量都没有了。忽然下起雨来，可少年依然跪在那里一动不动像是在赎罪。
过了好长的一段时间，少年终于拿起自己手中断掉的忍刀，做出准备切腹自杀的姿势。就在少年将刃刀用力插向自己的腹部时，忽然被一个人叫住。
“就这样死了有意义吗？”
少年听到这声音立即回头看去，激动得说不出话来。说话的是一位身穿日本传统武士服的中年男子，他慢慢地跨过那些尸体来到少年身边：“告诉我你的想法，零。”
“宫本老师，我违背了诺言使用了禁术，我不想解释，亦不想被原谅，除了切腹我想不到有什么活着的理由。”
“我明白了，零已经死了。”宫本老师拿过零手上的忍者刀扔掉说：“你从今天起就叫平宫秀一吧，过去的你已经死了，秀一今后你要迎来崭新的人生。”
秀一看着宫本老师问：“我可以吗？”
宫本老师笑着拍拍他的头说：“你以后就是我宫本才藏的徒弟了，不过要从清除丧尸这种初级任务开始，你做的到吗？平宫秀一！”
时间回到了二十多年前，当时的秀一是一个没有名字的孤儿，他的父母都是出色的“猎人”（一些拥有法术专门处理猎杀魔物的人，他们被称为猎人。），不过在生下他没多久就在任务中身亡。
当时这位连名字都没有的孩子，就被送进了“猎人”里最神秘的组织“匿名者”的训练营“伊贺忍者村”，这里是专门培养“匿名者”的地方。（猎人亦有腐化的时候，权利、金钱等等由于这些害群之马不断增多，所以在猎人内部产生了一个组织，叫做“匿名者”）
在伊贺忍者村这个可怜的孩子终于有了自己第一个名字“零”。进入忍者村的小孩，不论有没有名字，都会在这里重新命名。送来这里的孩子，不是孤儿就是被遗弃的，他们的身世都很可怜，所以“零”在这里和别的孩子并没有什么不同。
刚开始“匿名者”是非常隐密的组织，专门处理一些品行腐坏的猎人。后来渐渐地发展成为了一个严密的地下组织，有专门的培训基地提供人才，而“伊贺忍者村”正是这样的培训基地。
匿名者里日本的“伊贺忍者村”只是负责训练“调查兵团”与“刺杀兵团”。英国的“摩萨德”是负责培训“护卫军团”和“后勤军团”的。而最大的培训地在美国的“林肯基地”那里四种兵团的人都有培训。
一开始零在“伊贺忍者村”的日子并不好过，因为他长得瘦小，面容清秀，常被耻笑像女人一样。所以经常被同学排挤，而且变成了大家的取笑对象。后来渐渐地大家不知为何都开始疏远零，再加上他性格冷漠孤僻，逐渐被孤立了起来。
“伊贺忍者村”有十班每班二十人，最后每班只能有五位学生毕业，其余的要么失去成为匿名者的资格，要么送去加入后勤军团。零就被安排在第三班，这一班有很多成绩优秀的学员，大家都认为三班是最有可能进入刺杀兵团的。因为刺杀兵团招收人最少，所以可以进入刺杀兵团的人都是精英中的精英。
“你们谁亦不要偷懒，如果被我看到可是会追加受罚的！”一位长相凶恶，体型壮实的教官正在训导学生，他就是三班的教官熊本先生。
熊本先生穿着一身黑色的教官制服，他头上带着一顶刻有伊贺图标的教官帽子。
现在三班学生在进行倒立单手掌上撑，这时有位身形瘦弱的人满头大汗有些支撑不住。如果这时有人倒下，那么倒下的人要再加做两百个。
班长“峰”对那位同学小声鼓励道：“琅琊，你要坚持住，深呼吸，尽量不要去想自己现在有多累。”
班长是一位四肢发达，永远都精力充沛的热血男儿，他直立的头发和有粗又浓的眉毛，加上好像能喷火的眼神，一看就是正派形象。
从小在伊贺忍者村长大的就会是单字的名字，一般这些孩子都是牺牲猎人的后裔。而中途加入的就会被改成双字的名字，这些人很多都是被其他孤儿院送来的，这些人多数是及其不好管理的坏学生。当然单字的名字学生多数都有些父母的遗传，所以会被重点培养。
在一旁的“鹰”就是三班最优秀的一位，他讥讽班长峰说：“你先照顾好自己吧，不要管别人的闲事。”
鹰，高大帅气，头发齐肩眼神总有一种深邃的神秘感，各项成绩都十分优秀，三班虽然女生不多，但是大部分都对她有些爱慕之情。
这时的琅琊手臂都开始发抖，看来是坚持不住了，眼看就要倒下时班长竟然单手撑地跳起来移动身体，来到了琅琊的身边后用自己的腿勾住了他说：“一定要坚持住，琅琊，你要燃烧自己所有的力量。千万不可放弃，放心吧我会帮助你的。”
这么大的动作当然会被教官熊本先生发现，在他们身后一脚把他们两个都踹倒在地讲：“你们友谊这么深厚，那就一起接