此时，由于海贸同盟关东舰队尚在三崎，而且态度仍不明朗，故日本水军的任务仅为运送兵员、输送物资及伺机袭取朝鲜西海岸港口。所来大小船只总量虽近千艘，却较少装备火炮等重型杀伤器械，但朴泓畏敌如虎，眼见日本水军逼近，便尽毁所属战船，仓皇逃窜。
另一边的庆尚道右水使元均久经历练，虽已五十有二，仍深得朝廷信任。元均闻报庆尚道城镇陆续陷落，朴泓溃逃，欲与敌决战，断其海路。探查倭寇水军动向后，即刻带领十艘板屋船、十八艘挟船、十二艘鲍作船出海截击。
此时日本水军统帅九鬼嘉隆集合了藤堂高虎、胁板安治、加藤嘉明、来岛通总、菅野正影展开军议。
九鬼嘉隆率先开口，道：“诸君，我军首要任务为输送兵员物资，保障名护屋经对马岛至釜山海路运输线，并伺机袭取朝鲜西海岸各港口，完成太阁殿下水陆并进战略。而我军迟早将遇到朝鲜水军主力……来岛君，请把目前收集到的朝鲜舰船情报传达给各位一览。”
来岛通总命人将情报传达开来，然后道：“朝鲜水军主力舰船名为板屋船，船体不小，可载百人，两侧多设火炮，战斗时辅以箭矢，船首之下设有巨型铜兽护板用于撞击，但航速缓慢迟钝。
其余名为挟船及鲍作船者为护卫和快船，航速轻快而火力较弱。以下为沿海各道水军节度使名单，请九鬼殿下过目。”
九鬼嘉隆欣然道：“好，来岛君辛苦了。诸位，当我军遭遇朝鲜水军之时，先以鱼鳞阵前进，以铁炮及弓箭先行压制。关船及小早船当快速突进，避开敌之火力，射杀甲板之敌，与左右卫掩护主船，实施中间突破，接弦夺船，全歼敌军。
加藤君、胁板君，你们二位是太阁殿下心腹爱将，素来于陆战最是勇猛，然则今日海战亦需二位出力啊。”
加藤嘉明立时表示愿奋战至死，胁板安治也道：“九鬼殿下精通海战，威名远扬，而来岛君所属的村上水军也是国中名门，我等自不敢妄自尊大，谨听号令行事。”
九鬼嘉隆闻言极为欣喜，有他们两位太阁爱将支持，接下去的事情就好办了。随后，他便安排诸将任务，首先便是令藤堂高虎领一支舰队先行向西试探沿海。
藤堂高虎以勇著称，十余年前便投身于丰臣秀吉之兄秀长麾下，之后屡立战功，后来更被发现还有筑城及外交才华，深得丰臣秀吉喜爱——哦，他在原历史上的“更后来”还很受德川家康喜爱。
藤堂高虎率领约四十艘战船，于远处望见疑似朝鲜水军，大喜过望道：“哦！这就是朝鲜水军么，号令全军，擂鼓备战！”
藤堂高虎船队鼓点紧凑，气势惊人，庆尚道右水使元均见状亦下令擂鼓助威，令挟船、鲍作船批次出击左右包围，掩护主力舰队转向御敌。但日本在庆尚道势如破竹，无坚不摧，弑杀残暴之名早已在庆尚道水军官兵中流传，导致朝鲜水军人心惶恐，士气不振。
朝鲜水军挟船及鲍作船刚刚迎击敌军关船及小早船时，便先遭遇日军铁炮——即火绳枪的密集射击，朝鲜水军官兵慌乱躲避。
加之日船来的是经过京华工匠改进过的关船和小早船，远比原先的纯日式战船灵巧，朝鲜方面偶尔的还击居然难以造成有效伤害。部分挟船与关船对射，互有损伤之时却被敌军快舰包围，日船利用自身灵活优势以及射击压制，抢先于朝鲜船队中穿插。
加之日军主力的几艘安宅船上装有几门大筒——其实就是走私而来的二手京华三号炮，强大火力压阵之下，朝鲜阵型大乱。
朝鲜主力板屋船尚未完成转向，便已被关船前后夹击，朝鲜水军远距离遭铁炮及弓箭密集射击，接弦时又遭焙烙玉投掷，火起于甲板，船身也多处炸裂。日军趁机登舰夺船，在陆师战无不胜的士气加持下，大肆杀戮朝鲜官兵，后续批次则掩护射击，一时之间朝鲜水军大溃。
元均见大势已去，下令撤退，并传令向全罗道左水使李舜臣求援。元均重整船阵，以火炮齐射日军主力安宅舰，导致两艘安宅受损。
然而，此时朝鲜水军方面挟船及鲍作已然溃散，官兵弃船，元均领多艘板屋失去协护，立刻便遭日军小早船袭扰。他眼下对于关船及小早船的麻烦在于，板屋火炮难以瞄准，仅能以弓箭抵挡，但敌趁朝鲜被牵制之时，船队逼近以火绳枪速射，由于板屋船动作迟钝，官兵屡遭射击。
藤堂高虎以关船接弦板屋，再掷焙烙，登舰作战，元均实在没什么好法子可想，因此不敌，且战且退，终领四艘板屋船突围而出，而朝鲜水军其余战船均被日军俘获。
藤堂高虎见状大笑，道：“若朝鲜水军皆是如此，我军数月之内便能夺占全部港口，劫掠物资。来人，传报九鬼嘉隆殿下，就说藤堂队遭遇朝鲜水军主力，大获全胜，朝鲜西岸畅通无阻！”
说罢，遂令兵分两路，一路继续追击元均残部，一路夺占港口，休整船队。
九鬼嘉隆听闻藤堂高虎大胜，也是喜不自胜：“藤堂神勇！我原以为朝鲜水军训练有素，不可轻敌，未想竟如此不堪一击，由此可见我军海路无忧也。
朝鲜军备羸弱至此，归太阁殿下统御也是天命所归了。不过，未雨绸缪总归要有，眼下急需探查明国水军情报，以备