军队直接向议会负责，银河联盟早已经从地面军队的时代走出来，最主要的军事力量由十大舰队组成。这些舰队可以航行于星际之间，每一个舰队都拥有着轻易摧毁一颗星球的能力。舰队中服役军舰大约为一万艘，其中不包括运输补给舰。最具攻击力的就是各舰队总司令的神级舰艇编队。神级舰可以说是人类研究出来最强大的武器，一艘神级巨舰拥有主炮八百门，负炮三千六百门，长达三千米，防护罩能量高达十万度，上面还拥有各种战机和太空车近万，再加上至少八艘长达千米的护卫舰，那种攻击力几乎是毁灭性的，其负载的攻击力几乎可以轻易摧毁一颗普通行政星的所有防御设备，将其完全瘫痪。在整个银河联盟，正在服役的神级舰艇编队也只有这十大舰队司令的母舰而已。十大舰艇司令向军队的总司令负责，分别驻守在宇宙联盟外围行政星所属的不同星域。