万贞执意要南下，朱见深其实也知道拦不住。只不过自从他们分居，她就不许他留宿。几十年相依相伴，同进同出，突然间要斩断这种亲如一体的联系，由不得他心里空落落的，不做出点任性胡闹的事来，实在不知该怎么办。
这种感觉万贞同样有，因此陪着他把起行的时间拖了又拖，直至夏去秋深，才南下断峡。她离开以后，朱见深失魂落魄，精神不振，除了儿子朱祐樘的生活能真正牵动他的心以外，别的东西他都提不起劲。
加上没有万贞辅弼，精力不济，日常的政务很难做到周全，几乎全数托给了外朝处置；为了制衡外朝，他又倚重内廷的宦官。尤其是统领御马监的汪直，一方面为了使他为万贞办事时人手富足，另一方面也是怕宫中诸妃以为万贞失宠欺她，因而故意托以重权，放他开设西厂，在京师胡闹。
商辂厌恶西厂胡作非为，加上内廷宦官正在逐步侵夺外朝的权利，便劝谏朱见深要圣明勤政，莫使朝纲重现正统年旧事。
朱见深倒也听劝，便将西厂裁撤了。只是他如今神志颓废，没有了过去那种励精图治的心情，却担心自己寿命不永，等不到万贞回来，于是将号称不老，人称“活神仙”的李孜省其入宫中炼丹，以求长生。
商辂目睹主君日渐消沉，心中焦急，劝谏之余，不免对万贞有怨言，请皇帝不要纵容她出宫。朱见深心中不忿，怒道：“卿言甚无道理，朕欲立后时，卿等纷纷以此是家事，当由太后做主拒绝；如今万侍南下访亲，亦是家事，与国事何干？何劳卿等多言？”
商辂被驳得目瞪口呆，皇帝的消沉，真正的根由其实是他多年勤勉，但真正所欲的东西，却受内廷外朝压制，一直没能得到，也算情志不舒。如今万贞离宫，他日常没了能够对等说话劝导，疏解心情的人，陡然失了管束，自然是原来有多压抑，现在就有多反弹。
原本皇帝对内阁诸臣都客气礼遇，言必称先生，现在却是无论身份，一律呼“卿”，君臣之间的关系不复过往亲密，摩擦却日渐加深。汪直那西厂废了不过年余，就又重新设立。
商辂谏君不力，与汪直几次交锋都被皇帝拉了偏架，也心灰意冷，遂上疏请辞。皇帝将奏折留中不发，但等他二次请辞的时候，却是准了。
朱祐樘得父亲宠爱，启蒙之余常被带到朱见深身边，见他批准内阁首辅辞职，不由奇怪：“父皇，商先生是做错什么事了吗？”
朱见深摇头，他对儿子的关心是全无疑忌的，并不因为太子小小年纪过问朝堂大事而生气，却乐意细心跟他解答：“没有。若是父皇精力跟得上，能够每日朝会，勤政理事，有这样强力的首辅，自然是相得益彰；但现在父皇身体不济，不能常朝，首辅势强，则我家势必弱；他又不愿意因为父皇体弱，而与内廷司礼监分权，长此以往，不是好事。”
朱祐樘似懂非懂，只是关心父亲的身体：“父皇，您身体哪里不舒服？”
朱见深道：“父皇没有哪里不舒服，只是有些累了。”
朱祐樘信以为真：“累了，父皇就要多休息啊。”
朱见深笑了笑，点头答应，牵着儿子的手慢慢地沿着游道往安喜宫走。
万贞虽然不在宫中，但朱见深却仍令小秋和秀秀等人如她常住一般照料，自己也常领着儿子过来游玩小憩。
朱祐樘突然道：“父亲，有人说，万妃母害死了悼恭太子和我母亲，是真的吗？”
这样的流言蜚语，无论是朱见深还是万贞，都可以想像得到必会暗里流传。朱见深心中大怒，嘴里却温和地问：“谁说的？”
朱祐樘道：“我也不知道谁说的，反正就是有人让我知道。”
这孩子虽然天真，但却并不傻。朱见深听见儿子说出这样的话来，心中微宽，问：“那你相信吗？”
朱祐樘犹豫一下，摇头道：“万妃母要是想害我母亲，多的是机会，不用等母亲进宫。何况……母亲一直说妃母人很好，我也觉得妃母很亲切，让人信赖。”
朱见深不能为儿子分说这份亲切信赖源于何处，沉默片刻，道：“你知道判断就好。你妃母一生受尽世人诋毁，有些人往她身上泼什么脏水都不稀奇。你只要记住，这世间若有谁能够不惜自身，也要庇佑你平安的。除了我，就是她。无论世事怎样变化，你一定要对她保持足够的尊重，以免将来后悔。”
太子得他和周太后宠爱，尊贵无双，不似当年的他需要时刻衣饰整齐，打扮矜严。他头上没有戴冠，而是像寻常富贵人家的孩子那样留了个小髫，发顶上李唐妹替他剪了胎发的地方，不知何故，中间一直没有再长出来。
他摩挲着儿子头顶那块小小的斑秃，问：“你妃母戴的璎珞中间，常年垂的是一颗瓷珠。里面藏着什么，你看过吗？”
朱祐樘想了想，道：“我见过瓷珠了，不知道里面还有东西。能让妃母贴身珍藏，须臾不离的宝物，一定很贵重吧？”
“嗯。”他点头，道：“那是她亲生儿子头顶剪下来的胎发。她畏惧天命，怕会害了儿子，不敢亲近，不敢养育……可是，在她心中，这世间所有金珠玉器，宝石珍玩，都远不如儿子的一绺胎发贵重。”
朱祐樘还不懂这样的感情，也不知道其中所指，只是心里酸酸涩涩的，有些难受。
商辂离职，皇帝内廷外朝都没有了能够制约的人，行事