杰克.萨利......
生于地球历2117年11月23日，毕业于哥伦比亚大学军事学院，19岁加入海军陆战队，是海豹突击队第二小队的队员，官衔上尉。但在某一次绝密的行动中，他被敌人设置的诡雷炸中，失去了双腿......
那是一种带有生物毒素的炸弹，目的并不是将敌人撕成碎片，而是用生物毒素彻底破坏人的肌体组织，所以，他成为了22世纪这个科技发达时代的“稀有”残疾，一个下半身肌肉完全萎缩坏死的废人。
人许多时候都是这样，拥有的时候不去珍惜，失去后才开始追悔莫及。躺在病床上的他，早已经对生活失去了希望。或许对一个再也无法用双腿丈量土地的人来说，一切都是灰色的。
杰克萨利的双胞胎兄弟是一名科学家，曾接受过作为阿凡达控制者的训练，却在一次商业迫害的抢劫中被杀害。所以他接替了弟弟的工作。成为了一名志愿阿凡达，幸运的是，因为双胞胎的缘故，神经波动匹配很成功......在经过5年零9个月的漫长星际旅行后，他来到了目的地，南门二恒星系波吕斐莫斯行星的一颗类地卫星，星球上生物繁茂。
这是一个被称为潘多拉的星球。为什么起名叫“潘多拉”？因为这里的空气对于地球人是致命的，而且地表大部分被热带雨林覆盖，毒虫猛兽出没其间且凶猛异常，而土著的纳威人总是用有毒弓箭对付地球人，这似乎是一个蛮荒的星球，一片既不友善、也不适合人类居住的土地。
但这里却有着神奇的、能够改变人类能源结构的雷岩矿石，人们就像闻到腥味的鲨鱼，蜂拥而至。
第一次来到这样一片土地上的阿凡达杰克.萨利，首先就经历了被怪兽恐吓，接着被食人怪兽狂追的恐怖时光，然后又经历了夜晚被野兽围困差点丧命的危险一刻。幸好纳威人酋长的女儿奈特莉及时出手相救，他才不至于命丧丛林。
但这个遭遇恰恰给了阿凡达融入纳威人部落的机会。
纳威人没有杀他，反而让奈特莉担任他的教练，让他学习纳威人的生活和语言。这个经历改变了阿凡达的思想，使其很快对这片土地有了新的看法。
杰克.萨利在学习的工程中很快发现了潘多拉星球独特的自然地理和迷人景观，对于他来说，这个植被茂密、被森林覆盖的星球就象史前的地球。生活在这里的纳威人和森林的动植物之间有着神秘的联系，他们拥有和自然沟通的能力。他们按照大地之母艾娃的意志行事，而艾娃的代言人就是他们的圣树——灵魂之树，圣树的种子精灵就像海中的水母一样四处飘逸。
潘多拉星球的夜晚比白天更加迷人——到处是闪闪发光的植物、昆虫，圣树的枝条闪着迷人的光芒像柳枝一样随风飘扬，水中也生长着发光的植物。
在这里，自然是有灵性的。
杰克萨利和奈特莉穿行其中，脚踏之处就象先知的脚步一样闪亮，他们走在森林里，越过树林，跨过藤蔓，跃过溪水，恍若伊甸园里的亚当和夏娃。这是个什么样的地方？这里就象伊甸园！人类梦想中的天堂！
不仅如此，这里还是一个可以和灵魂沟通的地方，就是当纳威人用头发和圣树的枝条、和六条腿的重铠马、和伊卡兰（迅雷翼兽）相连，就可以与这些生物进行心灵沟通，就可以听到来自祖先的声音，可以把自己的意志传达给这些生物。在杰克.萨利成为了纳威人的武士后，奈特莉带领他去寻找自己的伊卡兰（迅雷翼兽），通过那些奇迹般的悬浮山（哈利路亚山）到达伊卡兰生活的绝壁，在那里杰克.萨利找到了属于自己的伊卡兰，并把自己的头发与之相连，达到心灵相通，心与灵魂自由飞翔的境界......
所以，杰克.萨利开始迷失了。究竟哪一个是真正的自己？是躺在病床上身上插满各种仪器的残疾海军上尉，还是在潘多拉丛林中自由奔跑、无拘无束飞翔的杰克.萨利？
庄周梦蝶，抑或蝶梦庄周？
人生总是充满了选择，而选择往往是最难取舍的东西......他的职责告诉他，他是海军上尉杰克萨利，但他的身体与灵魂却在呐喊，他是纳威人杰克萨利......就在他犹豫不决的时候，一支全部由老弱病残的远亲纳威人来到了部落里，声泪俱下的泣诉了人类犯下的累累恶行......烧毁家园树，屠杀纳威战士，这种方式与纳粹某国曾经实行的种族灭绝手段又有什么不同？！不是说好研究与采矿和平发展的么，为什么要对这些纳威人赶尽杀绝？
不知不觉间，杰克萨利已经潜移默化地倾向了纳威人阵营。而这时候，如果按照原剧情发展下去，则是杰克.萨利在潘多拉的丛林里找到了自己，找到了爱的寄托，对于他来说，潘多拉的世界是真实的，而地球人类的世界却和他的身体一样是残疾的，他决定要不惜一切保护纳威人，保护潘多拉星球，这个梦幻的天堂。
当然，他现在的思想或许还不成熟，只是一个刚刚诞生的苗头，甚至还没有成为魅影飞龙骑士。但是，这就已经足以改变他的行动了。在某一场捕猎行动中，出于种种原因，他并没有对那些人类同伴发出警告，任由他们被抓捕。
即使在被抓住之后，他也没有第一时间表达出友善信息，更是为了避免被发现而下意识的躲藏了起来。所以，他错过了最后的机会......
......
半天后，一名拿着长矛的纳威战