1883年8月27日，丁云桐正式向内务部下令，逮捕所有正受监控的日本间谍，彻底捣毁其在华的情报网，如有反抗，格杀勿论。
命令的末尾有两句醒目的话：
宁可错杀一千，不可放走一个！
活的没有，死的也成！
随后的几天里，遍及全国的大逮捕开始了。
在间谍密集的上海，早已准备就绪的数百名内务部秘密警察，全部手持柯尔特左轮手枪，对所有的间谍机构同时发动了袭击。
在昆山路，秘密警察冲进了玄洋社建立的东洋学馆，要里面所有的人全部举手跪下。正有几个东洋浪人，夹杂在十几名真正的日本留学生当中，叫嚣着要冲出去。眼见于此，秘密警察立刻就是一顿乱枪，将这些人全部打死了；
在浦东，日资的广业洋行，被秘密警察破门而入，其负责人松田满雄被当场逮捕；
在河南路，相邻的日清贸易研究所，以及乐善堂上海分店，被同时查封，日本间谍商人岸田吟香以及陆军大尉根津一，当场被秘密警察击毙；
在汉口，乐善堂汉口分部遭到搜查，荒尾精在被逮捕前，挥刀自尽；
在天津，松昌洋行以及天津乐善堂分部也被查封，负责人泷川具和、川畑丈之助随即被抓；
北京的青木宣纯逃跑途中被杀；山东烟台的宗方小太郎反抗被击毙；湖南长沙的钟崎三郎被捕；杭州的藤岛武彦自杀；假扮和尚，躲在浙江普陀山法雨寺的高见武夫跳海自尽等等，大批间谍几乎在一天之内被扫荡一空，日本用十几年时间，辛苦建立的间谍网几乎是被连根拔起了。
内务部马上对活捉的间谍，进行了残酷的突审，在确信已经榨干了一切有用的资料后，全部装上火车，连夜送往北京。
27日晚，数十名秘密警察涌入了军机处行走何如璋的家中，并将万分错愕的楢原陈政五花大绑带走，从他床下搜出大量资料，以及抄录的何如璋日记。见此，何如璋面如土色，嘴唇颤抖，被内务部一同绑走了。
楢原陈政泪流满面：“义父，是我害了你，我对不住你！”
何如璋不理他，自己却是捶胸顿足：“我昏聩，不察奸人计谋，有负君王，有负国家啊！”
30日，北京香山双清别墅，日方代表团驻地，首席代表井上馨拿着国内发来的电报，正与伊藤博文商量。
在电文中，日本政府基本同意了目前双方达成的各个共识，但还是有了新的指令：根据间谍的报告，朝鲜北方的铁路进展迅速，竟然已经抵达了平壤，大大超过日方的估算。因此日本政府要求伊藤等人，在双方的谈判中再次附加条件，要求中国暂缓铁路的修建。
在随后的瀛台会谈中，日方果然提出了这个要求，这让早已不厌其烦的李鸿章，更是火冒三丈。在向皇帝的汇报中，他直言日本人“狡顽无耻，不足与之共语。”
丁云桐却是一脸的灿烂，他不生气，只觉得好玩，他首先慰劳了李鸿章几句，毕竟扯淡了这么久，没有功劳也有苦劳啊。
然后，丁云桐很淡定的告诉李鸿章，不必再与日本人纠缠了，让他们直接滚蛋！之前的一切谈判一律作废！不过在此之前，要给他们看一场好戏，以示送别之意。
听到这话，李鸿章激动的热烈盈眶，他终于明白所谓的中日会谈，纯粹是皇帝在“逗你玩儿”。这些日子他可是憋了一肚子的火，现在总算是能发泄一下了。
8月31日，双方的会谈再次进行，但这一回会场气氛大为不同，中方代表个个表情暧昧，而李鸿章则是一脸的兴奋，甚至身子都微微颤抖。他直接干净利落的打断日方发言，说道：“由于日本代表一再提出蛮横无理的要求，可见日方毫无解决任何相关问题，改善两国关系的诚意。因此，本大臣正式宣布，谈判到此结束！同时中方严正要求日方立刻释放琉球国王，无条件归还窃占的琉球群岛。同时，中国将根据自己宗主国义务，对日本在朝鲜非法经济行为进行全面的清查！”
井上馨等人目瞪口呆，完全不明白事情竟会发生这样的转折，之前的融洽气氛，去哪儿了呀？慌乱之下，伊藤博文赶紧声称任何条款都可以重新探讨。
但李鸿章却不为所动，在尽情欣赏了一番日方人员的精彩表情后，中方人员全部离开了会场，只留下呆若木鸡的日本人。
9月1日，丁云桐下令，邀请日本使团以及驻华公使榎本武扬等，一起前往宣武门外的菜市口“观礼”。
日本众人不明其意，正午时分来到菜市口。
只见此地早已是彩旗林立，花团锦簇，弄得像过年过节一般。两旁酒肆茶楼人山人海，中间空地上，方阵一般排列着几十架铡刀，每个铡刀上都躺着一个犯人，手脚拴在前后的木桩上，动弹不得，腰部上方正对着雪亮的铡刀口。
日本人这才明白，所谓的“观礼”，原来是叫他们来观看腰斩犯人的。
所谓腰斩，就是刀斧将犯人从腰部一分为二，“手足异处”。听起来残忍，其实最开始是一种文明进步，早期殷商时代的死刑，都像是在吃人肉，如“醢”是把人剁成肉酱，“脯”是把人做成肉干，“炮”是把人烤成熟肉，而“镬烹”是把人煮成肉羹。
直到周代，渐渐文明起来，才用“斩杀”代替“烹饪”，斩就是腰斩，杀就是砍头。开始是刀斧，jishu难度较大，逐渐改用铡刀，又快又容易，包公的三