说实话林大鑫的一封要派定北军去福建省平叛的电报，真是给大清这帮人吓住了，慈禧太后、光绪皇帝和恭亲王奕欣一合计，虽然李鸿章的一封电报劝阻了林大鑫，让他不会插手福建省的事情，但是为了防止夜长梦多，必须尽快解决福建省的叛乱。
于是光绪皇帝下旨，增加了平叛大军的规模，让武威军的第3镇也加入了平叛大军，使得平叛大军达到4个镇，由武威军统帅依克唐阿亲自担任平叛大军的总指挥。
而南方诸省也受到了林大鑫那封电报的消息，一下子把福建省周边的2位总督吓了一跳，这要是让林大鑫那个煞星进入了福建省，凭借林大鑫那个贪婪的样子，绝对会赖在福建省不会走的，想想有林大鑫这个人做邻居，两江总督刘坤一和两广总督岑春煊顿时感觉冷飕飕的。
两江总督刘坤一马上给朝廷发电报，福建省的叛军倒行逆施，他老刘这么忠于朝廷的总督岂能坐视不理，他愿意派出两江的新军主力，配合朝廷平叛大军，进入福建省剿灭叛军。
两广总督岑春煊也紧接着给朝廷发了电报，意思说虽然广东的第22镇因为兴中会的暴动损失惨重，但是他岑春煊怀有一颗拳拳报国之心，愿为朝廷肝脑涂地，就算第22镇损失再大，他岑春煊也会抽调一支规模不小的新军，屯兵在广东和福建交界处，准备配合朝廷平叛大军，剿灭福建省兴中会的叛乱。
光绪皇帝看着2位总督前后天壤之别的电报，无奈的叹了口气，早知道他就直接给两江总督刘坤一和两广总督岑春煊发电报，说林大鑫想进入福建省平叛，说不定两江和两广的新军在福建省叛军没有壮大前就进入福建省，平息了这场叛乱，现在只能让朝廷的平叛大军走一趟了。
原来兴中会的福建革命军接受了日本人上杆子给的军火之后，立刻像滚雪球一样的膨胀起来。不但把福建革命军中3万多配备冷兵器的部队全换成了步枪，而且又继续大肆扩军，特别是把从广东省和江西省赶过去的会党成员都吸收到了福建革命军中，短短不到10日的时间。就让福建革命军又扩充出来3个镇。
如此一来，福建革命军一下子就变成拥有6个镇10万多兵力，这也让大清现在只依靠两江和两广的新军，已经难以平定福建省的这次起义了，只有等待从北方来的4镇平叛大军。
不过福建省的战局没有等到武威军第3镇和第4镇、北洋军的第10镇以及定武军的第13镇进入福建。就产生了新的变化，福建革命军扩军之后，攻打福州一线的福建革命军增加到了4个镇，由福建革命军总司令王和顺亲自带领，对清军发起了猛攻。
4月4日，福州的门户永泰县城被福建革命军攻占，守城的江西新军第16镇、福建新军19镇以及福建巡防营的官兵退守福州城，随后福建革命军开始日夜猛攻福州城的城墙，但是福州城内清军兵力在永泰县攻防战之后，依然有近1.2万人。除了一部分是福州以及周边各县巡防营的官兵，大部分都是江西新军和福建新军的官兵，战斗力还是比较强的，加上来援助的江西新军第16镇那个协拥有的20门口径75毫米的山炮，让福建革命军连续3昼夜的猛攻之后，伤亡万余人，也没有攻破福州城防工事。
福州战事的转折在4月7日，福州城内的会党成员联系了江西新军第16镇那个协里面的会党和兴中会安插的人员，聚集了500多武装人员在深夜从福州城内对南面的城门发动了突然进攻，虽然闽浙总督许应骙也有所防备。但是3天的攻防战，让守城的清军非常疲劳，猝不及防之下，福州城的南门被打开。随后城外等候已久的福建革命军趁机攻入福州城，并于第二天彻底占据了福州城。
福州城的清军一部分在巷战中战死，一部分放下了武器向福建革命军投降，还有近2800人保护着闽浙总督许应骙，从福州城突围，向北面宁德城方向逃去。
福建革命军得势不饶人。总司令王和顺留下一部分官兵收拾福州城的烂摊子，自己则带着近4万大军继续向北进攻，4月6日宁德城被福建革命军一战而下，闽浙总督许应骙带着从福州城逃出来的清军，还没有从福州城被攻破的惊恐中缓过来，在宁德城根本没有士气抵抗，福建革命军还没有到宁德城，许应骙就带着近2800人的江西新军和福建新军弃城而逃，只有宁德城的几百名巡防营，对福建革命军的先头部队倒是放了一阵枪，不过等王和顺带着福建革命军主力到了宁德城下，几百名巡防营轰然而散。
闽浙总督许应骙带着残兵一路北逃，直到退出了福建省的地界，到达了浙江省南雁荡山一带，和浙江新军第20镇剩下的唯一1个协汇合在一起，才停住脚步，在南雁荡山一带构筑工事，防止福建革命军继续向浙江省腹地进军，同时闽浙总督许应骙一天3、4封求援的电报发给北京城，并且又向自己的好友两江总督刘坤一发电报，希望看在多年的情分上，拉兄弟一把。
福建革命军几乎不费吹灰之力，就把剩下半个福建省收入囊中，不过这时兴中会已经得到了清廷已经派出了4个镇的新军，直奔福建省而来的消息，这4个镇的新军可都是最早成立的新军部队，每个镇都有3万左右，训练有素，武器装备精良，如果不小心应对，弄不好现在的大好局面就会毁于一旦。于是孙文和王和顺等兴中会的领导人们一商量，决定暂时停止向福建省外进军