在理清楚所有人的关系之前，我先设定一个前提，碇源堂司令是个任人唯亲的性格！
在漫画动画或者tv剧场版里，我们看到的都是明确并且相对简单的人物关系。
以碇源堂为核心，冬月幸增是他的助手和参谋，同时也是他大学时代的老师。
他的妻子碇唯是研究eva的科学家，应该是当时的首席吧！
有个儿子碇真嗣后来成为eva的驾驶员。
手下有葛城美里以及副手，加持良治是他的间谍，赤木律子是他的情人兼科学顾问。
绫波丽是他妻子的复制体，渚薰是他本人的复制体。
此外的另三名驾驶员是司令的儿子碇真嗣，真希波玛丽和物流·明日香·兰格丽。
好！人物分类清楚，我开始脑补。
首先，司令有2个孩子，分别是碇真嗣和物流·明日香·兰格丽。
其次，司令还有个妹妹，真希波玛丽。
加持良治和冬月幸增的关系是父子，而葛城美里也是因为是其女友才成为指挥官的。
脑补完毕，下面是理由。
不得不说，碇源堂又或者说六分仪源堂，是个极其聪明，高智商，并且执著的人。
在他得知有个全世界最秘密的科学工程eva的的时候，他为了和碇唯结婚连姓都该了。
在他参与了之后发生的几次事件都有他的影子。
第二次冲击。是nerv或者说是seele做的，为的是用人类的基因让亚当更贴近人类，同时在次基础上有对亚当灵魂的研究，而司令但是正好不在场，应该就是先一步运送走了亚当的灵魂，关于封印灵魂的技术，看看nerv里的那些黑红色墙纸就行了。
在这次事件中，司令用的是他自己的基因，所以渚薰才会叫他爸爸。
2000年，葛城探险队在南极发现的东西是巨大的人形生物，四个光之巨人。
其中一具躯体，被人类基因冲击后成为了*失落之数*的*尼布甲尼撒之钥*。
另三具成为了没有灵魂的躯体，被制造成为初号机，6号机，8号机。
从这个事情中就可以看出，司令对整个人类补完计划是*全身心*的投入的。
碇唯为什么驾驶初号机？因为司令就只相信自己的老婆，可没想到的事情是老婆没了。
这里要提到一点的就是nerv或者说是seele对灵魂的研究在进步。
而第二个实验驾驶的人是物流·明日香·兰格丽的妈妈。
如果说实验有危险，那么军方有的是自愿者，可为什么是这两个女人呢！
因为他们都是司令的女人，而物流·明日香·兰格丽在之后被选择为驾驶员，显然也是因为身份是司令的女儿，当然这些事情在表面上是看不出来的。
由于对灵魂的研究在进步，物流·明日香·兰格丽的妈妈并没有死在驾驶舱里，可她的灵魂被留下了。
第三个实验驾驶eva的人真希波玛丽，在对灵魂的研究不断进步的结果就是，她是唯一一个没死，而且一点没事情的人，那她的身份就耐人寻味了。
有张碇唯和碇源堂抱着出生或者是刚满月的碇真嗣的照片，其中还有谁！？
司令的老师冬月幸增，以及一个没人知道名字的眼镜娘！没有亲密的关系这个女人怎么会出现在照片里？在这里提醒下，高智商是会遗传的，同样近视也会遗传的。答案就是她最大可能就是司令的妹妹，至少司令不会带明日香的妈妈出现在照片里。
以下要提到一个神秘的组织，马尔杜克机关。
为了选出eva的驾驶员而设，直属人类补完委员会的咨询机构。因为是非公开活动故正体与组织不明。（提出的“马尔杜克报告”就是选出的驾驶员）
构成马尔杜克机关的108个关联企业有106个都是晃子，存在的夏侬生化公司和外商卡米凯尔公司也只是个空壳。
马尔杜克对nerv提出的“马尔杜克报告”其实都是nerv内部自己做的。
加特说过其实马尔杜克正体就是nerv高层。
马尔杜克之所以要伪装，是为了让源堂可以自由的选择适任者而不被一般人看出所用的。
所以，说司令任人唯亲是有理由的，不是自己的大老婆，就是自己的小老婆，再后来是自己的妹妹，然后是自己的两个孩子，最多再加上自己的复制体儿子和老婆的复制体躯壳。
也是因为有了马尔杜克机关的运作，大小老婆和妹妹都成为了驾驶员，一对子女也被指定成为驾驶员，就连由于驾驶了eva后永保青春的妹妹，都被改了年龄和名字成为了驾驶员。
如果不是女儿和妹妹身上亚裔血统的特征明显，司令巴不得她们表面和自己完全无关系呢！
物流·明日香·兰格丽：eva2号机的驾驶员，也是和零同样受过特殊训练的“第二适格者”.德国人.由于被遴选为适合操纵eva的第二适任者，所以也在德国接受训练.她在美国长大，身上却有四分之三德国裔和四分之一的日本裔血统.她已有在德国大学毕业的学历!是个天才少女.她负责的贰号机平时最为稳定，她和eva的同步率经常是最高。
这智商，这血统，叫人怎么能不多想。
真希波·玛丽·伊兰崔亚斯，国籍：英国（“破“的蓝光dvd版内的册子里标明）
性别：女年龄：14生日：2001年3月31日
新剧场版：破中新出场人物，棕色的双马尾，蓝绿色双瞳，带着红框板材眼镜，发带是a10神经连接端口。是一个