五世**喇嘛阿旺罗桑嘉措被清政府册封为‘西天大慈自在佛所领天下释教普通瓦赤喇怛喇**喇嘛’，他在刚刚重建好的布达拉宫与世长辞了。五世**的亲信弟子桑结嘉措，根据罗桑嘉措的心愿和当时**的局势，秘不发丧，隐瞒了僧侣大众和当时中央的康熙皇帝，时间长达十五年之久。并且在保管秘密的同时，也开始了秘密查访五世**的转世灵童的工作。
康熙皇帝在平定准噶尔的叛乱中，偶然得知五世**已死多年，十分愤怒，并致书严厉责问桑结嘉措。桑结嘉措一方面向康熙承认错误，一面找到多年前寻到隐藏起来的转世灵童。
藏历火兔年，仓央嘉措被选定为五世**的‘转世灵童’，此时仓央嘉措已十四岁。是年九月，自藏南迎到拉萨，途经浪卡子县时，以五世班禅罗桑益喜为师，剃发受沙弥戒，取法名罗桑仁钦仓央嘉措。同年十月，于拉萨布达拉宫举行坐床典礼，成为六世**喇嘛。此时的**，政局动荡，政治矛盾已到达了极其尖锐的时期。
藏历金蛇年，固始汗的曾孙拉藏汗继承汗位，与第巴（即藏王）桑结嘉措的矛盾日益尖锐。
藏历木鸡年，桑结嘉措买通汗府内侍，向拉藏汗饮食中下毒，被拉藏汗发觉，双方爆发了战争，藏军战败，桑结嘉措被处死。作为**的仓央嘉措自然在劫难逃了。事发后，拉藏汗向康熙帝报告桑结嘉措‘谋反’事件，并奏称六世**仓央嘉措不守清规，是假**，请予‘废立’。康熙帝准奏，决定将仓央嘉措解送北京予以废黜。
藏历火狗年，仓央嘉措在押解途中，行至青海湖滨时染病去世，按照传统实行天葬。而藏族最高是塔葬，只有高僧才可以使用，天葬一般普通民众都可以使用。
关于仓央嘉措被黜后的命运大致有四种说法：一、在解送京师的途中，行至青海湖（位于青海省海**族自治州）湖畔圆寂。二、仓央嘉措在路上被政敌拉藏汗秘密杀害。三、仓央嘉措被清帝囚禁于五台山上，抑郁而终。四、好心的解差将仓央嘉措私自释放，他最后成为青海湖边的一个普通牧人，诗酒fēng_liú过完余生。
据说，在那个寒冷的冬天，在凄冷荒凉的青海湖畔，仓央嘉措并没有死去，他逃了出来，此后隐姓埋名地活到了六十四岁。
至于他是怎么逃出来的，逃出来之后又去过哪里，这就众说纷纭了，大多数人比较相信的是一种‘阿拉善说’，似乎也有很多证据证明这是真实发生的。而且，就算还有别的一些说法，和‘阿拉善说’也没有本质的冲突，到最后都可以归入到这一大类里。
‘阿拉善说’的大概情节是，仓央嘉措逃了出来后，四处云游，先后周游了青海、甘肃、蒙古、四川、**、印度、尼泊尔等地，据说曾当过乞丐，送过尸体，生活极为艰苦。
后来，他来到现内蒙古阿拉善旗，从此在此地生活，先后担当了十三座寺庙的住持，讲经说法，广结善缘，创下无穷的精妙业绩。多年以后，六十四岁的仓央嘉措染病去世，但他的事迹为广大阿拉善人民传诵，当地人民为他修建了灵塔，供奉了他的遗物。