携手创世的众神自此分裂，三界之内，到处都在杀戮不休。
而蒙生灵之气所诞生的众神造就了无穷孽障，世界几乎因为众神间的争斗而崩溃。混沌自最深邃的黑暗中重现了。它肆无忌惮的毁灭着一切，欲将天地归还于原初之时的寂静与虚无。但始终坚持庇护生者命运的生灵之气却变成了它最大的敌人。
最终，它们在天地之间相互消耗，它们的结局，亦是一同归于沉寂。
将近凋零的生灵之气于沧龙火海之内化为了紫琊神石，在星空炼火的世界中等待复原。它是万物生命的种子。但混沌之气亦是于涵虚之境内化为了混沌神石。此后受紫琊神石之影响，世间有女娲造人，使得大地生机勃勃。可混沌神石的力量亦是能够支配天地万物，它一直在同紫琊神石以神力抗衡不休。
如此，上神女娲造出人类，混沌之气便使得天柱崩折洪水泛滥，将世人灭杀无数。随后深爱世人的女娲炼石补天，又有大禹息壤止水平息世间大难。可世界才方安定，天空中又有十日并现，使得稻禾枯干，民不聊生。紫琊神石再复化生出后裔，箭射九日安天……
无论是洪荒恶兽，还是上古仙雄。如此循环往复斗了万年时光，世间亿万生者在无情的天道之中艰辛生存。但人们为了谋取生存的利益，使得好不容易安定下来的天下九州征战不息。
时逢轩辕黄帝一统海内，击败战神蚩尤。自人心中生长出的那无穷的怨恨，使得混沌神石提前崩裂化为了混沌之祖。她降临世间，将整片洪荒位面俱都陷入了混沌虚无之中。
天下间恶气充盛，人们宁愿屈从于内心中的阴暗，也不肯拥抱原初之时的光明。世间虽未重归于混沌之中，但却更较一片虚空的世界险恶阴森。此时有鸿蒙众位上神预知到了一场席卷宇宙的大浩劫即将诞生，遂在轩辕黄帝的引导下升宵而去，不知去到了哪方世界。
升宵而去的众神命华夏部族的七支后裔镇守洪荒压制混沌魔气的诞生。他们守护着黄帝留下的无上之圣器——轩辕剑。世世代代都以抵御混沌为己任。但历代轩辕后族陨灭无数，最终只剩下了七位洪荒先祖还在奋战不息。却因七祖势单力薄，进而无法阻止混沌之祖的力量覆灭洪荒。
紫龙众神以四大道尊为首于离恨天的位面通道施展参天法力，镇压向世间侵袭的混沌之气。但四大道尊亦是措手无策，只能以浑厚法力拖延时日。若想要彻底解除混沌之危，拯救三界内无数生灵。唯有凭借紫琊神石内生生不息的力量。
可世间的凡人与众神谁也没有能力，令那在沧龙火海之内沉寂了无数时光的紫琊神石重新复苏。但它庇护世人的决心与意志，终于令紫琊神石在距今一万年之前的岁月里苏醒了。
他出自沧龙火海，万千星辰炼火为其塑造金身神体。星域浩渺银河之中群星璀璨，而他是其中最闪亮的星辰。自男子出世之后神帝亲命道尊前去迎接仙长登临紫龙上界。他于万神称颂之中受上界仙箓神位，封为紫琊仙君，举世独尊。
此时的混沌之祖已制服洪荒七祖，将欲破开洪荒重临三界。紫琊仙君为挽救世间亿万生灵，孤身而去洪荒位面与混沌之祖相抗衡。这期间仙君于洪荒云梦泽内，与天地间第一位九尾神狐阿青相遇，两人许下永恒之约。但最后的结局令人感伤。
仙君燃烧轮回，于人界东海上方重归沉寂。而混沌之祖，则是被仙君拼死禁锢于涵虚之境内万载岁月。而今宵万年已过，风雪依依。紫琊仙君燃烧轮回之后转世为人重修大道。然而那混沌之祖却也撕破了涵虚之境的封印，再度侵占了洪荒位面。
……