“终于期末考试结束了，我要好好放松放松，该干些什么呢”这名刚考试完期末考试的高中生名叫叶智一，从小就是神奇宝贝的忠实粉丝，从最初的关东到之后的日月他都历历在目。
“你好有人在家吗，有您的包裹”，门外传来了快递员的声音，叶智一跑过去打开了门，可是没有人在门口，只看见了地上有一个包裹，叶智一迷惑了“我没有买过东西啊，上面竟然连寄件人是谁都没写”。
叶智一好奇的打开了包裹，当他打开时候，叶智一兴奋地连话都说不出来了，包裹里正是自己一直想要的太阳月亮的游戏机，这个游戏机在国内可火热了，看电脑里直播大神都玩这个，可是自己就是买不到。
“太棒了，不知道是谁给我的，不管了，先玩一下”，叶智一按下开机键，进入到了游戏界面，界面左上角突然跳出一个信封，叶智一有点触笔点了一下，信封打开后，里面的内容是这样的：看得出来你很喜欢神奇宝贝，想不想体验一下真实的感受确定或者放弃。
叶智一刚开始还以为这是游戏设定就选择了确定键，谁知道游戏机突然爆炸，叶智一来不起逃跑，就消失在这个世界上了。
“嘶，头好痛，我在哪”，叶智一已经重生在了另一个平行宇宙中，然而叶智一自己不知道。
叶智一向四处张望了一下，看到地上那个破的闹钟，突然醒悟“纳尼，难道我穿越了，我，成了小智”，叶智一实在不敢相信自己竟然穿越成了小智。
“小智，你今天不是要成为神奇宝贝训练家吗，再不起床就要迟到了”，小智的妈妈花子在楼下喊小智起床了。
“哦，好，知道了，我马上起来，妈”，叶智一不太习惯突然叫别人妈而且还是在不知所措就穿越的情况下。
小智跌跌撞撞的准备好了一天的所有准备，刷牙，洗脸，穿衣服，吃早饭，因为他知道如果自己很早去的话就拿不到那只拥有无限实力的皮卡丘了，“给，小智，你的换洗衣服，睡袋，洗漱用品，还有···”，花子吧东西塞进了小智的背包交给了小智，“妈，你东西放得有点多了吧”。
刚背上背包的小智感觉有点吃力“没有啊，这些都是必需用品，快去大木研究所吧，妈看好你哦”，花子笑着对小智以示鼓励说道。
小智走到了大木研究所的门口，走人群里小智就听见了“小茂小茂真厉害，小茂小茂加油”，小茂拉拉队的声音，后来看见了小茂走出了大木研究所。
小茂望见小智嘲讽的说“你就是小智吧，不用回答，我知道你就是小智，你第一天就给我迟到啊，作为我的竞争对手你还真是弱”，小智就在那装作什么都不在乎的样子看着小茂。
“算了，和你说话简直是浪费我的时间”小茂不耐烦的结束了话题，“小茂小茂加油”“谢谢大家，谢谢，各位男朋友，女朋友们，我一定会成为神奇宝贝大师的，我一定会让真新镇这个名字传遍全世界”之后小茂坐上自己的专属跑车离开了大木研究所，送行的人也都各回各家，各找各妈去了。
“那个小子真是欠揍，以后看我不超越你”小智双手握拳气愤的说道。
这时候大木博士走到门口看到了小智“诶，这不是小智吗？”小智反应过来后对着大木博士询问“大木博士，我的神奇宝贝呢”“你的神奇宝贝？”“嗯，我的神奇宝贝”小智觉得还是暂时跟着剧情走一下，万一领到的不是神奇宝贝那该怎么办。
“说的也是啊，可是他们告诉我今天预定有四个人”，大木博士说道。
“没事的啦，反正我就是那第四个人嘛，总之，我的神奇宝贝呢”，小智满心期待的说道。
“那好吧，你跟我来”大木博士领着小智进入到研究所里面，小智按照剧情打开了三个原来装着三只初始神奇宝贝的空宝贝球，“大木博士不是预定了四个人吗，应该还有第四只神奇宝贝吧”，小智询问大木博士问道。
“有是有，只不过剩下的那只神奇宝贝有点问题”大木博士思考了一下。
“反正我迟到也是我有问题，总之那只神奇宝贝给我好不好”小智恳求大木博士说道。
“好吧，给你”大木博士把有闪电标志的精灵球交给了小智，小智开始期待这个精灵球里的到底是不是皮卡丘。
“出来吧，我的神奇宝贝”小智丢出精灵球，精灵打开了，一只皮卡丘，出现在了桌子上，“这只神奇宝贝叫做皮卡丘，又名电气老鼠，平常比较害羞，不予人类亲近”大木博士介绍道。
“皮卡丘~”皮卡丘叫道,“皮卡丘，你好，我是你的训练家，请多指教”小智友好的跟皮卡丘打招呼，皮卡丘一脸不屑的把头转了过去。
“有点麻烦，皮卡丘，你是不是讨厌待在精灵球里”小智想起了这件事情并对皮卡丘说道。
“皮卡~”皮卡丘对于这个知道自己讨厌待在精灵球里的人开始有点认同。
小智试着去抱起皮卡丘，“皮卡~”皮卡丘欢快的叫了起来，并没有想剧情里一样电小智。
大木博士看到这里也有点惊讶，也开始对小智有点认同了，“小智没你很不错，一开始就让自己的神奇宝贝认同自己，很难得，那么这是鉴别礼，神奇宝贝图鉴和神奇宝贝球”大木博士拿出神奇宝贝新手都有的东西。
“谢谢大木博士，那么我就收下了”，小智收起了皮卡丘的精灵球，接