大明天启七年（公元1627年）九月初一，英国公张惟、内阁首辅黄立极主持了朱由检的登基大典。
登基大典在皇极殿举行。
太常寺官员先行祭天，礼部官员祭地，宗人府的官员则在朱由检的率领下，来到交泰殿，召告列祖列宗：新皇将立，大明皇室源远流长，千秋万世……
金吾卫的一名校尉在祭坛前放下一座金椅，面南背北。另外放置一个宝案，案上放着一件紫红色绣龙皇袍。
黄立极率文武百官捧着放置皇袍的宝案上前跪奏：“祭礼成，请即皇帝位。”
群臣拥着朱由检来到金椅前坐下，执事官举着龙袍，站在朱由检身侧，张惟上前取下皇袍，披在朱由的身上。
音乐起，群臣行三跪九叩之礼。
朱由检示意平身，群臣平身，音乐止。
黄立极捧上传国玉玺，近前一步：“皇帝进登大位，臣等奉上御宝。”司礼秉笔首监魏忠贤接过玉玺，放置盒中。群臣再次拜见，山呼万岁。
朱由检受礼后，命百官平身，张惟和黄立极率百官退下。
朱由检正式登基，年号崇祯，取“重振大明江山”之意。
新皇登基，大赦天下，除了谋反大逆之罪，全国所有在押犯人全部释放。因为近年来并没有发生谋反的事，全国所有的罪犯全部释放，监狱一时清空。
大臣们因为拥戴朱由检继位有功，理应的得到封赏，但朝廷官员重叠甚多，暂时以赏代封，职务不变，等有空缺时再行封赏。
朱由检追怀生母刘氏，赐谥曰孝纯恭懿淑穆庄静毘天毓圣皇太后，也就是后来所称的孝纯太后，择日迁往庆陵，和生父泰昌帝合葬。
朱由检封王妃周玉凤为兰馨皇后，宫女婉儿为菊妃。胡心雪由于得到大赦，已经脱罪，封为梅妃。
因为正式登基，朱由检不能住在宫外的信王府，他必须住在乾清宫。婉儿与胡心雪还在陕西未归，他身边的女人只有皇后周玉凤，周玉凤也随他住在乾清宫。
新皇初登大宝，朝廷给假三日作为过渡，三日后，朱由检将第一次临朝。
“陛下，你看，这床铺可满意？”周玉凤知道朱由检喜欢躺床上看书，她让木匠给朱由检的龙床添置了一个靠背，又在靠背上放置了一个厚厚的衾枕。
“凤儿费心了！”朱由检捏捏周玉凤的玉手，心中暗暗发笑，他现在已经是皇帝，将来肯定要增加妃子的数量，晚上在哪儿睡觉都说不定，真要关心，那就应该在你的凤床上这样安排，也许更实用。
周玉凤正要说话，宫女彩儿来报：“陛下，皇后娘娘……不，该死……张皇后差人来见陛下。”彩儿是周玉凤的陪嫁丫头，是和周玉凤一道进入勖勤宫的，现在又来到乾清宫服侍周玉凤。
“张皇后？张嫣/她差人来干什么？”朱由检有些疑惑。“带她来见我。”
“是，陛下。”彩儿将一位宫装模样的女子带了进来，原来是朱由检和周玉凤的熟人，张嫣的贴身侍女婷儿。
“奴婢叩见陛下。”婷儿向朱由检行过礼，发现周玉凤也在，“奴婢叩见皇后娘娘。”
“婷儿，是皇嫂让你来的？”朱由检明知故问。
“是陛下。皇后娘娘……张皇后让奴婢来请示陛下：陛下初立，兰馨皇后必定入住坤宁宫，张皇后请陛下赐宫。”
按照宫制，坤宁宫是皇后的居所，朱由检当了皇上，张嫣当然要让出坤宁宫。朱由检皱了一下眉头：“婷儿，回去告诉皇嫂，现在先帝丧礼未过，朕不是寡恩之人，还是待先帝丧礼过后再说吧！”
周玉凤的红唇张了张，想要说些什么，但她看到朱由检皱起的眉头，到底没有开口。
“还有什么事吗？”朱由检间婷儿还在磨蹭着，没有立即离开的意思。
婷儿看着朱由检：“张皇后说了，陛下一定要注意茶水饮食。”
原来还是为了宫内的安全，朱由检和周玉凤对视了一眼，“让皇嫂费心了。回去告诉皇嫂，朕的一切饮食，都是来自信王府。”
“奴婢知道了，奴婢这就去回复张皇后。”婷儿福了一福，飘然而去。
朱由检正待与周玉凤调笑一番，徐应元来报：“陛下，魏忠贤求见。”
“魏忠贤？他进乾清宫，什么时候需要通报了？让他进来吧。”朱由检打起精神：“凤儿，你先退下。”
周玉凤刚刚退出，魏忠贤就进来了：“老奴叩见陛下！”魏忠贤行了大礼。
“哈哈，起来吧。魏公公，感冒可曾好了？”
魏忠贤从地上爬起来，垂首立在朱由检的座椅前：“蒙陛下关心，老奴已经好了。”
“奥，那就好。魏公公这么急来见朕，有什么要紧的事？”
魏忠贤双手一揖：“陛下，老奴伺候先帝多年，已经年老力衰，最近常常遗忘一些旧事，求陛下恩准老奴回归故土。”
“嗯？”朱由检深深打量魏忠贤一眼，发现魏忠贤并没有去宫回乡的哀愁，“忠贤，你欺朕年轻不是？”
“陛下，老奴哪敢欺陛下？”魏忠贤慌忙下跪，用头叩地，以表达他对朱由检的一片赤诚之心。
“忠贤，你先起来。”朱由检待魏忠贤爬起来，“忠贤伺候先帝多年，对宫内宫外事务十分熟悉，是先帝最为重要的帮手。现在朕初登大宝，正是需要你这样的熟手相助，忠贤却要离去，难道，朕不配做大明的皇帝？”
“陛下，老奴该死。”魏忠贤叩头如捣葱