无论如何，朝廷首先是得成立的，刘云虽然身在北京，但身边也没有什么人可用，现在开始召集一些重臣，于是江南的一些官员就赶来了。首先就是马士英，然后就是高弘图，王铎，历史上，这三人就是南明弘光政权的内阁三成员，三人之后，又来了个史可法，这史可法倒是让刘云侧目，因为历史上他就是民族英雄，除此之外，还来了一批其他官员。令刘云意外的是，这些官员中除了南京的官员，竟然还有个地方官，湖广总督何腾蛟！嗯，历史上这何腾蛟也是抗清英雄，是个好官。
值得注意的是，现在的官员之中有不少人是东林党人，以前东林党是反抗魏忠贤的先锋势力，在民间民声很不错，但后来阉党垮台之后，东林党就渐渐变成一个谋求政治利益的集团，历史上南明政权内部的政治斗争中，东林党与马士英等反东林党人士的斗争，就是主要的内耗。另外，文人士大夫还组成了另一个政治组织，就是复社。东林党的成员大多是在职官员，是朝中的政治势力，而复社跟东林党有所区别，复社的成员多是没有官职或官职较低的中青年，实际上就是一些喜好评论时政的愤青组织。复社的成员有许多都是东林党人的弟子，所以东林党和复社的联系也很紧密。历史上，在南明政权中，复社成员也参与了政治，不过却很难说这些复社成员对国家有什么功绩，因为他们大多把精力放在内部斗争中去了。
刘云对东林党和复社有所警惕，因为他们都是政治组织，而且，他前段时间招的顾炎武、黄宗羲、方以智也都是复社成员，只是刘云没有给他们任何权力罢了，现在他们还只是一群小孩子的老师。说实话，刘云对明朝出现的什么党并没有好感，例如阉党，它本身就是明末政治腐败的根源之一，而与之抗争的东林党，起初和阉党斗争的时候是代表正义的一方，但历史上北京陷落后，东林党人在南明小朝廷还在和阉党残余斗争，都国破家亡了，还不能捐弃前嫌一致对外，这些“党人”的行为在实际上已经对国家有害。
现在，刘云要把朝廷重建起来，要做的事情就是要让这些官员把地方官吏，地方民政管理起来，重新建立税收系统，再把那些被破坏的地方的生产恢复起来。不过现在军权在刘云手里，而钱财刘云也不缺，所以没有什么需要完全依赖这些官僚的，刘云可谓大权在握，想怎么拿捏这些官员都可以。因此，刘云准备建立一个全新的朝廷，并且禁止结党，禁止党争，他可不想让大明朝在未来的某个时候灭亡于党争。
于是，刘云就这样开始了第一次早朝，时间嘛，不用太早，就定在辰时三刻，也就是早上八点四十五分，这个时间让皇帝和大臣都不会太辛苦。以前的崇祯天还没亮就开始早朝，大臣在下面打呵欠，这样商议朝政，能有什么效率？一阵“万岁”之后，刘云让诸位大臣平身，现在，他们还都没有什么“正确”的官职，因为流贼之乱，北京城的大臣已经去得七七八八，现在来的大多是南京城的大臣，官职上和一些北京大臣有所冲突，是时候调整一下了。
于是，平身之后，马士英便站出来道：“皇上，如今朝政混乱，朝中六部根本就无人，是不是应该重新任命官吏，以稳定朝政。”
此时，一个五十多岁的中年人站出来道：“皇上，如今朝廷缺少银两，若要重开六部，首先户部就要有银钱才行，若官员无钱无俸，朝廷恐怕难以运作。”
此话一出，朝廷上顿时嗡嗡作响，这什么人啊，要钱要得这么直接，虽然这话说得有点直，但也是实话。刘云听得又好气又好笑，心道：“好嘛，我刚刚把这些人叫来，他们什么事都还没办成，就开始要钱了，这都什么人嘛！”刘云悄悄问了一下旁边的近侍，才知道原来刚才发话那人却是钱谦益，官职还不小，历史上在南明小朝廷里，钱谦益任礼部尚书。不过，钱谦益之所以出名，更是因为他娶了一个身为“秦淮八艳”的妾室——柳如是。不过，钱谦益的节气并不怎么样，南明危急时，柳如是劝钱谦益投湖尽节，而入水后钱谦益却推托“水太冷”，最后没死成。最后，钱谦益还是降清了，这人既想反清，又想保存自己，想法很复杂。
于是，刘云便道：“众爱卿放心，钱不是问题，我可以先出五百万两银子救急，不过，组建六部之后，就得把税收上来，去年一年我都忙于和外敌交战，根本就没有收税，你们谁也别想推托。”
此时，众臣听说刘云要出五百万两，便齐声道：“皇上圣明。”屁，皇上不圣明，是他出的钱圣明，刘云暗暗腹诽道。不过，这些大臣都感到奇怪，流贼攻入京城，皇帝出京，而不久后就率领军队攻了回来，而且后来皇帝的“私人军队”越来越多，竟然有几百万之多，先后和满清、外国入侵者打了几场仗。不管皇帝的军队是从哪来的，总之皇帝能养得起这么多军队，定然有无数钱财，所以这些大臣第一次上朝就让刘云出钱。
现在刘云四人在次元舱里储存了黄金两万一千吨之巨，而白银则有三十万吨之巨，之所以会有这么多黄金，完全是因为搜刮了两个时空的黄金，尤其是上一个时空，由于有了现代化的机械