杨秋池现在共有二十二万大军，根据前期作战情况，进城后他重新进行了整编，组成六个集团军，每个军下辖三个师，总共十八个师。每个军都由传统步兵、重甲骑兵、轻骑兵、火炮兵、火铳兵、工程兵、后勤保障兵等混合兵种组成，而且，都是配备了一定数量的老套筒骑兵、马克沁重机枪射手、炸药火炮（当然，弹药由杨秋池自己根据作战需要，战前亲自统一调配）。这样组成的每支集团军，都能独当一面，进可攻，退可守。
他对各级军官根据战功重新进行了调配，将六个集团军中装备最精良的一支由自己亲自率领，作为嫡系部队驻守京城，任命李定国为军师（总参谋长），负责作战计划制定以及各集团军平时军事训练的部署和督导。任命龙炳、阿杏妮、武麒、刘勇、马凌羽这五个能征善战跟随自己的铁杆亲信分别担任其余五个集团军的军长（副总兵），将这五个集团军驻扎在山海关南下通道上，掐断李自成难逃的通道。同时准备迎击多尔衮清军南下。
杨秋池的大将军府设在五军都督府。五军都督府的设置类似于一般衙门，只是，它由五部分组成，分中左右前后五个都督府。现在大明放眼天下，已经没多少成建制的军队了，真正具有大规模建制的军队，就他这二十二万新军。所以，没人敢和他一起住进这都督府里。这样，偌大的都督府实际上就全成了杨秋池的了。
只不过，这五军都督府是各自独立并列的五个大衙门院落，他一家人也住不完，所以，杨秋池将自己的办公地点和住处设在最靠近皇城承天门的中军都督府。其他四个都督府全部改成了武器制造局，这样，也方便自己配置武器。
原先的京营兵已经在与李自成的作战中消耗殆尽，所以。杨秋池将自己驻扎京城的嫡系集团军中最精锐地老套筒骑兵团留了一支做自己中军都督府护卫之外，其余都布置在了皇城四周，担任皇家警戒。这让袁贵妃为首的皇族感激涕零。更赢得了满朝文武的交口称赞。
由于皇上没了，大部分大臣尤其是一众武将不同意太子即位，朝中最高权力出现了真空，而繁杂的政务必须要人料理。袁贵妃和杨秋池商量之后，下懿旨指大学士入参机务的内阁辅臣范景文。率同户部尚书倪元璐和大理寺卿凌义渠，三人暂代理朝中日常政务。杨秋池这才腾出手来忙碌制造弹药。
进城第十天，杨秋池最担心的事情终于发生了，山海关吴三桂传来紧急军情----多尔衮带十万大军强攻山海关。请求增援拿着吴三桂地一封亲笔信，兴匆匆来到中军都督府拜见杨秋池，双手递上吴三桂的信。
杨秋池见他那笑眯眯的样子，就知道吴三桂肯定同意把陈圆圆送给自己了，拆开信件一看，果然，吴三桂亲笔信里，先表明了一番忠心。然后解释说陈圆圆是他老爹的义女，自己地干妹妹，并不是外面传闻的妾室，老爹做主许给杨秋池。他双手赞成，而且。为干妹妹有了好的归属而高兴。同时，信里再次请求增援山海关。
吴襄等杨秋池看完信，笑呵呵问道：“大将军，现在是否定下日子，确定何时迎娶小女圆圆为侧王妃？”
杨秋池摸了摸下巴，皱眉道：“这……，目前军情紧急。这件事暂且放下。等击退多尔衮大军再说。如何？”
吴襄当然是想尽快结成这门亲事，免得夜长梦多。不过，杨秋池抬出紧急军情这个大幌子，他可不敢乱说话，忙陪着笑答应了。
陈圆圆这件事杨秋池本来就只是用来对付吴三桂的一步棋，没想过要纳她作妾，甚至到现在还没见过这个有名的大美人，他生怕柳若冰听到风声伤心，便再三叮嘱吴襄，让他在自己作决定之前，切不可张扬。吴襄本来是打算回去就开始准备婚事，以便杨大将军随时可以迎娶过门的，听了这话，虽不清楚大将军用意，但也只得答应了。
吴襄走后，杨秋池立即召集最高军事会议。军师（总参谋长）李定国和龙炳等五个集团军军长到齐之后，杨秋池简单通报了吴三桂的紧急军情。问大家该如何应对。
李定国文武全才，所以，以往召开军事会议，杨秋池都让他先说作战计划，大家在这个基础上讨论同意后，遵照执行。只不过，这一次作战有些特殊，因为中间还夹杂着吴三桂和李自成。所以，杨秋池没让李定国先发言，让其余五个人先说。
刘勇腆着肚子粗着嗓门最先发言：“大将军，咱们进城不久，便派人前往招安李自成，这老小子现在还没答复。卑职认为，他是想抬抬价码，多要点好处。”
龙炳点头道：“是，卑职与这厮曾经交过手，他的军队作战勇猛，的确是个劲敌，他估计是想用这一点跟大将军讨价还价。大将军上次招安，只是让他归顺，没谈具体条件，所以，估计这老小子想待价而沽。”
马凌羽冷声道：“再怎么待价而沽，也不能让他领兵了，这厮出尔反尔，现在被咱们围困在这里无法脱身，说不定就想着借招安脱困呢，这一招他以前又不是没玩过！”
武麒一拍大腿：“没错！干脆直接灭了这小子得了，面生后患！”
阿杏妮道：“我也觉得，这一次不管怎样，不能放虎归山，他一旦南窜，再想围剿他，难度可就太大了。现在北面山海关有吴三桂地五万大军，咱们南北夹击，一举灭了他！”
杨秋池听了，心中暗笑，这阿杏