首先尊奉冲虚子为初代祖师，全阳真人为再传祖师，仅存的几位洞虚、合道期存在奉为宗门太上长老，专心修炼。
神游、阳神、定府期存在担任各大要职，管理全宗。金丹期潜力不足者，担任外门长老，培养宗门下一代，潜力巨大者成为一代真传。剩下的玉液、筑基期成为内门弟子，炼气期为外门弟子。
真传弟子以“玄云通道月端静，白玉乘虚日清圆，凌空星朗一丹天，太上渊微显妙元”二十八字依序论资排辈，道号由辈分和诗中余下字按顺序组合而成。
也就是说一代真传是玄字辈，道号分别是玄云、玄通…..玄元；二代真传是云字辈，道号分别是云玄、云通……云元，以此类推。
其次收徒择优，尽归外门，走传统采气炼气的路数，考验磨练心性，筑基之后才能进入内门，绝不允许徇私舞弊，攀亲带故。全宗大力培养天才人物，争夺真传名号。
最后所有宗门典籍都对门下开放，但需用宗门贡献值兑换。也就是说不管你是什么身份，只要你宗门贡献值足够多，就是仙级功法也可以换取。
此举极大的加强了宗门凝聚力和竞争性，也保证了玉清宗最优秀的天才可以获取众多功法，博采众长，走出自己的道路。
都说大难不死，必有后福，玉清宗自改革后，从上到下焕然一新，人人励精图治，专心修炼。
老祖全阳子在大劫中，历经战火淬炼猛进，万余年后成为大乘期修士，乃玉清宗擎天之柱，尽心为后辈保驾护航。
又经万年时光发展，玉清太上长老和长老中各有一人成为大乘期修士，一代真传也有一人脱颖而出，晋升大乘。期间最为轰动的莫过于全阳子功成天仙，成为玄洲顶级存在。
至此在拥有仙人坐镇的情况下，玉清宗一门三大乘，威震玄洲，执玄门牛耳。
这些年，因为大大小小的劫难，玉清宗虽有断代情况发生，但整体实力越发强盛，前前后后已有十几代真传，但每代金丹真传只取二十七人，竞争激烈。
王卓这批外门弟子，资质出众，犹胜往昔，被人看好的真传候选有好几位，都是人中龙凤，盖绝当代的天骄。