实际上在荷兰殖民者一开始占领巴达维亚后就发现这个地方不光是各种需要建设的物资紧缺，甚至就连耕作劳动建设城镇的当地劳动力也是有着巨大的缺口，所以荷兰殖民者在一开始的时候就不择手段从各地诱骗华侨甚至到中国东南沿海掳掠人口供其役使，后荷兰殖民者嫉视华侨在发展经济上所起的作用，又怕他们同当地人***合起来反抗殖民统治，转而采取严格限制入境，乃于推行起了排华政策。
在这些排华政策中，当属逮捕“失业”和无居留证的华侨，然后遣返回国或者转卖他处，为了有合理的理由荷兰殖民当局干脆下令捉拿被诬为窃贼的华侨，这样下来以至于有些无辜被捕的华侨或被虐杀或被投入大海。
后世中的某位大佬曾经说过，哪里有压迫哪里就会有反抗，所以这些聚居在城内的华侨在看到已经不分青红皂白只是对着华侨来的事实后选择了逃往城外，对于这种近似于打家劫舍的盗匪一般行为华人们只得选择了反抗，然而在这些华人在公推出首领准备进攻巴达维亚城时，像许多故事***现的一样这种松散的因仇恨组成的组织必然会出现叛徒，所以在不久后就因走漏消息而被荷兰殖民当局有所准备。
在一七二零年的时候由于欧洲蔗糖市场逐渐饱和，以至于爪哇的甘蔗农场面临来自更便宜的巴西蔗糖的激烈竞争，许多华人农场主在破产之后一些绝望的失业者成为了暴民，对于这些暴民荷兰当局选择了准备将他们强行转移到锡兰。
于是在第二天荷兰当局明确规定：凡是最近十年至十二年内居留在巴城的中国人，未申请领取政府所颁发的居留准许证者，一概驱遣出境。而由巴城华侨所写的《开巴历代史记》记载，这年盗贼四起，警察抓获的罪犯大多是穿黑衣黑裤的唐人。
所以荷兰当局经商议后下达了凡是看到穿黑衣黑裤的人一律捉拿的命令，这样造成的结果不仅是无业游民外加真正的暴民被捕捉，就是许多住在城里的较为富裕的华侨也遭了殃，这样就使得华侨与荷兰殖民者之间的矛盾进一步加剧。
因为听说被遣送锡兰的苦力上船后会被投入海中于是华人苦力拒绝登船，要知道聚集在甘达里亚糖厂附近的苦力人数超过五千人，可是这种松散的组织必然会出现见利忘义之徒：华侨中一个名叫林楚的叛徒在留在巴达维亚城的诱惑下向殖民当局告了密。
而荷兰殖民者便以华侨准备进攻巴城为由发开始行动了，首先殖民者以搜查军火为名命令巴达维亚城内华侨交出所有利器——包括菜刀和铡刀，然后全副武装的荷军挨户搜捕华侨不论男女老幼只要捉到便杀，这种对华侨进行血腥洗劫的屠杀持续7天，以至于城内华侨被杀近万人，被焚毁和劫掠的华侨房屋达六、七百家，财产损失更是无法估计。
这就是当时震惊爪哇、中国和欧洲的巴城大屠杀，由于因巴达维亚城西有一条河叫做红溪是肇事地点之一，故被后世史学家们称之为“红溪惨案”。
相信任何一个对于华侨生存状况的人都知道这个开创了后世中一个名叫印尼国家的恶劣先河，然而和后世中频频出现的屠杀洗劫不同的是，这次的红溪惨案却让整个荷兰王国感到震惊乃至于不安。
当惨案发生传遍了世界之后，没有人想到这一次倒霉的并不是在屠杀中幸存下来而又被荷兰殖民当局抓捕的华人，而是在经过了荷兰国会一连三天的紧张讨论后做出了一个让任何后世中国人都大快人心的行动。
作为一开始准备杀鸡取卵的荷兰总督华尔庚尼尔对于这次屠杀华人是抱着补偿他在总督位置上亏空的目的，而他补偿亏空的目的也就是为了能够让荷兰国会那些大佬们对他抱有好感，能够让他继续在这个位置上面坐下去。
然而，当他费尽心机的将数额为一百多万的亏空补上之后，从荷兰王国首都传来的消息却让他摊在了座位上面，经过荷兰国会的长时间辩论，作为文明人的国会一致认为这种事情发生在欧洲任何一个国家里面，都会招来这些人的祖国的强烈干涉，正是看准了这点后荷兰国会一致担心处于盛世中的乾隆政府的军事报复以及断绝经济方面的往来——假如失去了和乾隆政府的贸易后荷兰将会失去他最大的市场和奢侈品来源地，这些可不是荷兰国会这帮子贵族王公们所乐意见到的。
于是，正为自己补上亏空而沾沾自喜的巴达维亚总督华尔庚尼尔的愿望并没有实现，他在后来被逮捕之后扔进监狱并死在了里面。然而，一向以天朝上国自居的乾隆政府却做出了让后人感到不可理喻的决定，在红溪惨案传到了大陆后，作为福建总督策楞和提督王郡得知后并将此事上奏给了朝廷。
只不过作为后世中被清朝遗老遗少们吹捧为开明帝王的乾隆却有着另外的一种看法：这些被杀华侨是“自弃王化”、“系彼地土生，实与番民无异”、是“彼地之汉种，自外圣化”，因此这些生活在巴达维亚的华侨遭受屠杀是“事属可伤，实则孽由自作”而“圣朝”无须加以责备，也就是说对这件事采取了不闻不问的态度。
唯有福建总督和提督两人感到这件事绝对不能这么容易过去，于是半明半暗的禁止了荷兰王国的的通商贸易，最终使得巴达维亚陷入了萧条。值得注意的是在一六零三年曾发生西班牙殖民者屠杀菲律宾华侨达两万多人的事件，明朝