2183年
银河系议会控制区域
坐标：机密
一座没有任何标识的巨型空间站里，一名特工正在汇报着什么。在这件空旷的办公室玻璃窗之外，是一颗巨大的红巨星。
“薛帕德把所有的事都完成了，这超过了我们的预期。”这名名叫米兰达·罗森的人正在看着那颗红巨星。
“指挥官薛帕德，揭开了真相。”坐在阴影之中的神秘男子正在吸着昂贵的香烟。
“但是这远远不够。”米兰达说着，转过了身。
“我们正处于战争之中，没有人愿意承认，但是这是事实。人类正在遭遇袭击。”神秘男子掸了掸烟灰。
“但是他们派她去打桀斯，桀斯！”米兰达看着神秘男子，“我们都知道那不是真正的威胁，收割者就在外面。”
“那就要靠我们来阻止他们了。”神秘男子从秘书手里接过一份报告。
“理事会不会相信我们的，他们不会接受我们的帮助。”米兰达叹了口气，“但是薛帕德，他们会听她的，她是个英雄，一个真正的偶像。但同时她也不过就是个普通女人罢了。如果我们失去了薛帕德，人类会跟着一起坠落。”
“那就确保我们不会失去她。”神秘男子熄灭了香烟，用他那略带诡异的蓝色眼睛看着他的得力干将。他背后的墙上，依旧是那个巨大的橘黄色镂空六边形标志——塞伯鲁斯。
银河系界神星系欧米茄星云
阿玛达星系
星系联盟海军ssv诺曼底sr－1号护卫舰正在执行例行巡逻任务。这艘拥有银河系最尖端隐身技术的护卫舰可以在混乱的界神星系之中穿梭自如而不被敌人发现。
这里集结了来自银河系四面八方的精英人才。舰长星系联盟海军n7特种部队指挥官人类幽灵珍妮·薛帕德中校、生物异能者星系联盟海军中尉凯登·阿兰科、驾驶员星系联盟海军飞行中尉杰夫·莫罗、前c－警官突锐战士盖拉斯·瓦卡里安、克洛根赏金猎人莱克斯·厄德诺、奎利工程师塔莉·佐拉、阿莎丽普洛仙专家同时也是强大的生物异能者莉亚娜·t苏尼以及星系联盟海军最优秀的舰员。就在两个星期之前，这支小队成功粉碎了一次针对整个银河系的重大阴谋。他们在最后关头击溃了企图召回大部队的收割者前锋——霸主，粉碎了收割者入侵银河系的计划。
但是尽管神堡理事会最终认可了人类对于银河系所作出的巨大贡献并且吸纳星系联盟加入了神堡理事会，但是他们拒绝相信收割者存在的事实。他们把一切责任归咎于死去的叛变幽灵——萨伦·阿特留斯以及他手下的人工智能种族桀斯。
薛帕德再次奉理事会之命，进入界神星系，处理桀斯危机。
这只是一次普通的例行巡逻任务，就像两个月之前那次试航任务一样。情报指挥甲板里衣服井然有序的样子，所有人都在自己的岗位上忙碌着。诺曼底号刚刚进入了欧米茄星云，这里是混乱的界神星系的中心，是海盗、军阀、雇佣兵的天堂，诺曼底号的每一个船员都绷紧了自己的神经。
“我们简直是在浪费自己的时间。”导航员普莱斯利抱怨个不停，“在这里花了整整四天时间却连桀斯的飞船的尾灯都没看见。”
“上个星期这里有三艘飞船失踪，一定发生了些什么。”驾驶员joker分析着。
“我打赌是奴隶贩子干的，界神星系里到处都是这些家伙的踪迹。”普莱斯利看着界神星系的星图。
“远程扫描仪发现了一些东西，不明身份飞船，像是一艘巡洋舰。”副驾驶报告。
“与所有已知信号都不符合。”joker感到了一丝不安。
“巡洋舰正在改变航线，已进入截击航线！”副驾驶发出紧急报告。
“不可能！隐形系统还在工作，桀斯不可能知道我们在这里。”导航员普莱斯利感到不可思议。
“这不是桀斯！立刻准备进行机动规避！”joker拉响了警报。
但是为时已晚。巨型巡洋舰的离子束主炮朝诺曼底号打了过来，尽管已经进行了紧急机动规避，诺曼底号还是被击中了。一个推进引擎被击毁，船舱内开始起火爆炸。短路引发的电气火灾从机械室直接蔓延到了驾驶舱，导航员普莱斯利和副驾驶在这第一lún_gōng击之中就失去了生命。
“动能屏障失效！引擎熄火！武器系统无法启动！谁去把驾驶舱的火灭了！”joker看着显示面板大声叫着。
巨型巡洋舰的攻击还在继续，诺曼底号一次又一次的承受着打击，船身不停的剧烈震颤着，大火开始在各层甲板之间蔓延开来。
凯登跑向了二层的生活甲板，指挥官正站在控制台前下达弃舰命令。
“求救信标已经准备好发送。”珍妮戴上了呼吸者头盔。
“星联能及时赶到吗？”凯登表示怀疑，毕竟这里可不是议会控制区域。
“星系联盟不会抛弃我们的。”珍妮抓起一个灭火器，丢给了凯登，“我们只要坚持住，让所有人进入逃生舱。”
“joker还在驾驶舱，他不肯弃船，”凯登对准身边不断蔓延的火势打开了灭火器的喷嘴，“我也不走！”
船舱内又发生了一次爆炸，船身剧烈震颤，形式已经是万分危急了。
“我需要你把所有船员带进逃生舱，我去管joker。”珍妮拉住了凯登的手。
“指挥官。”凯登看着面前的珍妮。
“凯登！走！立刻