方金芝转身一看，失声惊叫：“那个小丫头呢？她何时跑了？”方杰说道：“她可能在我们运功疗伤的时候偷偷逃走了吧。我原本只是打算用她做人质，以便阻挡他们的追击。现在她既然已经跑了，我们又与她无冤无仇，那就算了吧。”方金芝说道：“那只好这样了。唉，算便宜了那个小丫头了。”方金芝和方杰经过一夜打斗和奔跑，此时感到又累又饿，急忙从怀中拿出面饼和水吃喝了起来。两人吃罢之后，稍作休息，方杰说道：“姐姐，没想到我们几年苦练武功，重返大宋之后，本想先杀了狗官，再杀了皇上，报仇雪恨，以振声威。不成想连番受挫，险些丧命，竟然碰到了这么多高手，真是太小看他们了。现在看来，他们防范甚严，很难得手，我们只好改变策略，先从梁山人及其后人下手，这样会更容易些。”方金芝感到言之有理，急忙说道：“通过这两次刺杀来看，要想刺杀成功确实不易。所以，我同意你的分析和决定。”方杰和方金芝休息之后，两人不敢停留，立刻展开轻功，飞掠而去，很快消失在黑夜之中。
那么，方杰和方金芝为什么要冒险行刺宋徽宗和高俅呢？
原来，方金芝是方腊大哥的女儿，后来她被方腊收为义女，人称“金芝公主”；方杰是方腊之侄，人称“神勇无敌”，有万夫不当之勇，号称南国第一勇将。方杰当年阵前斩杀梁山猛将“霹雳火”秦明，又力战关胜、花荣、李应、朱仝之后，身心疲惫，正纵马回阵时，被卧底的柴进和燕青偷袭。方杰猝不及防，被燕青一刀刺中，落入马下，鲜血直流，疼痛难忍。方杰又气又恨，强忍伤痛，奋起神力，手持方天画戟，一招杀神破碎，逼退柴进和燕青之后，迅速突围而去。
宋江率领梁山好汉，神勇无敌，打得方腊损兵折将，丢城失地，兵退杭州。方腊审时度势，自知江山难保，于是便命方杰和方金芝，保护小公子方亳和小公主逃走。并再三嘱咐：“今后一定要重建明教，推翻宋朝，另建南国，造福于民，切记！”方杰和方金芝心如刀绞，悲痛欲绝，只得领命而去。方腊知道这一别，可能再也无缘见面，虽然心痛难忍，但是他毫无办法。
宋江率领大军势如破竹，迅速包围了杭州城。方腊亲自指挥将士拼死抵抗，寡不敌众，死伤惨重。方腊见大势已去，无力回天，万般无奈，被迫率军突围，跑到老家青溪帮源洞一带，继续拼命抵抗。结果又被梁山好汉和官兵击败，方腊只好退进洞中，负隅顽抗。
宋江率领大军将方腊团团围住，成了瓮中之鳖。武松在进洞激战中，奋起神威，猛扑上前去，单臂擒住了方腊，从此威名远扬。
方杰和方金芝带着小公子方亳和小公主正在逃难，正好遇到逃出来的方七佛和人称“小养由基”的庞万春之弟庞万秋，这才得知方腊和妻子邵仙英已经被俘，正在押往京城。方杰、方金芝、方亳痛不欲生，心急如焚。方杰和方金芝怒火万丈，发誓要去救回方腊。
方七佛颇为冷静，急忙劝解道：“大家不要冲动，我们势单力薄，现在去了就等于送死。我们死了不要紧，那圣公的子女怎么办？谁来保护他们啊？”庞万秋紧接说道：“是啊，我们现在的首要任务，就是赶紧找个地方安顿下来，将圣公的子女抚养成人，重建明教，再报仇雪恨，而不是现在白白去送死。”方杰和方金芝感到言之有理，他们在万般无奈之下，只好强忍心中悲痛，带领方七佛、庞万秋、方亳和小公主等人远赴苗疆，以便躲避朝廷的追杀。方腊和妻子邵仙英被押往京城，秋后便被朝廷处死。
方杰和方金芝、方七佛、庞万秋、方亳和小公主等人，历经千辛万苦到达苗疆之后，方杰向苗疆酋长做了大概说明，请求留在苗疆避难。酋长见方杰英雄神武，气宇轩昂，甚是喜欢。不仅答应了方杰的要求，而且他把的女儿苗怡玮许配给方杰为妻，方杰惊喜万分，感激不尽。
苗怡玮不仅年轻貌美，武功不凡，而且用毒如神，飞刀绝技，更是百发百中，江湖人称“蛇蝎美人”。方杰和苗怡玮结婚之后，夫妻恩爱，相敬如宾。方杰雄心勃勃，开始重建明教。他打开方腊临别之时交给他的小盒子，只见盒内装有一本明教圣经和一本明教武功秘籍——《大明十六式》。于是，方杰遵照圣公方腊的意愿，立小公子方亳为明教教主，立方腊之女为明教圣女，方杰和方金芝为左右天王，方七佛和庞万秋为左右护法。由于方亳年少，无法主政，由方杰暂代教主之职，负责教中一切事务；方金芝负责小教主和小圣女的学习、生活及练武等工作；方七佛和庞万秋则返回大宋，重建明教各分舵。
明教，是从波斯传于中国，方腊据此创立了明教，自命教主。并以红巾为标志，迅速聚众数万，起兵造反，声势浩大，可惜功败垂成。方杰为了不引起朝廷的注意，决定将明教改为神龙教，以掩人耳目，从而躲避朝廷的追杀。几年之后，方杰率领妻子苗怡玮、方金芝、方亳及圣女等人，重返大宋，准备杀了宋徽宗、蔡京、童贯、高俅和梁山好汉及其后人，以报国恨家仇，最后推翻宋朝，重建红巾南国。
那么，燕南飞到底上哪去了呢？原来，燕南飞被方杰放下之后，发现自己既没受伤也没被点穴，顿时心中大喜。她趁着方杰和方金芝运功疗伤之时，悄声慢步走出破庙，然后撒腿