你是否真的相信会有灵魂附体这样的事情存在呢？怎么可能，这是最不可能发生的事情，这样的事又怎么会发生在神奇宝贝世界这样的地方呢？
不，你错了！这你就大错特错了！在宠物小精灵的世界里曾经有过这样的一个古老的神话：曾经在神奇宝贝刚出现的时代两个儿时要好的少年发现了一种神秘的湖泊！他们先后进入湖泊游泳却阴差阳错地使得后一个进去的附体在了先一个身上，因此后人称这种湖泊为灵魂湖泊，不过迄今为止那个湖泊在那以后就消失无踪谁也不知道它在哪儿，从何而来又去向何方？
就是这样神秘的湖泊后续又神秘地出现在了合众地区的大陆上，也使得后续雷鸣附羽的故事发生。合众地区第一的神奇宝贝猎人附体在了我们主角大大宿羽的身上。
说道这里有人要问了，雷鸣是怎么样的人，这个主角宿羽身上又有些什么故事？雷鸣，全名：紫焰雷鸣，一切的开始都是由他引起。他是紫焰家族中最会训练神奇宝贝的，曾经所训练的神奇宝贝都是完胜所有族人的存在，被迫之下他曾经被选为族长。可是就是这样的一个意气风发的训练家根本就不想被自己的命运所束缚，活生生地想训练出其他系别强大的神奇宝贝！至此成为了紫焰一族唯一训练电系的训练家（紫焰一族：使用火系神奇宝贝世家，绝不允许自己的族人使用其他属性的神奇宝贝。），后继加入早期电浆团，随着电浆团逐渐地恶化，他也因为任务的安排成为了小精灵猎人。或许是他的天赋异禀又或者是他的实力过硬，至此他的人生开始登峰造极！成为了合众地区家喻户晓的第一神奇宝贝猎人！
宿羽，全名蓝水宿羽。我们的主角大大，他的故事比起雷鸣的起来就显得平淡无奇了。他只是单纯的一名热爱神奇宝贝的少年，小时候父母曾经给他向镇子里的朋友的女儿定下了娃娃亲一一也就是我们的女主大大，汐！全名源水汐，实际上宿羽早就可以开始旅行了，但因为某种原因（各位都清楚）与汐约定好，等到她满十岁两人便开始一起旅行，一起领初始精灵！可是呢？事情就是那么的离奇，在两人一起领神奇宝贝的时候。刚好剩下的两只神奇宝贝中一只被他从小玩到大的哥们宇飞领走，无奈之下虽说还有一只，但也只好让给了汐（三选一另外一只暂时不做交代，这是后话。）他自己也就之后匆忙地拿着精灵图鉴离开了研究所。
作为宿羽的铁哥们宇飞当然是特别讲义气的，约定好当晚与宿羽去附近的一处森林里捕捉一只神奇宝贝作为宿羽的初始神奇宝贝，当然了，真正的故事也就从这开始……;